ОТЗЫВ ОБ ИСПОЛНЕНИИ  НАУЧНЫМ РАБОТНИКОМ  ДОЛЖНОСТНЫХ ОБЯЗАННОСТЕЙ ЗА АТТЕСТАЦИОННЫЙ ПЕРИОД
за аттестационный период с «___»________ 2015г. по «___»________2020г.
 (за период 5 лет с даты предыдущей аттестации; при первичной аттестации – с даты поступления на работу в ИБХ РАН)

	Фамилия, имя, отчество научного работника: 
Некрасов Алексей Норбертович ________________________________
	Структурное подразделение: 
Отдел биоинженерии______Лаб. инженерии белка______
	Занимаемая  научным работником должность  (на  момент представления в аттестационную комиссию отзыва): 
ст. н. сотрудник________________________________________________
	Дата начала работы научного работника в данной должности: _________________01.06.2009____________________________________

	Мотивированная оценка профессиональных и деловых качеств аттестуемого научного работника (если научный работник является руководителем научного подразделения – также оценка его организаторских способностей)1): 
За время работы в лаборатории А.Н.Некрасов проявил себя как активный и высоко квалифицированный специалист с глубокими знаниями и широким кругом научных интересов. А.Н.Некрасов доброжелателен, точен в выполнении научных исследований и отличается оригинальностью предлагаемых им научных подходов. Научные интересы А.Н.Некрасова связаны со структурной организацией белков, рациональным дизайном белков, взаимодействием белковых молекул и исследованием механизмов их функционирования. Он интенсивно взаимодействует с сотрудниками ряда других подразделений ИБХ РАН, что нашло отражение в разнообразии объектов, которым посвящены его научные публикации. В последние годы после завершения разработки методов дизайна белковых молекул А.Н.Некрасов начал разработку методов проектирования молекул пептидной природы с заданной пространственной организацией. Первые публикации в этом новом научном направлении им уже сделаны.

	Оценка результатов профессиональной деятельности научного работника: 
При разработке методов рационального дизайна белков А.Н.Некрасов выполнил ряд фундаментальных исследований, что позволило ему предложить метод Анализа ИНформационной Структуры (АНИС) белков. АНИС метод выявляет иерархическую организацию белковых последовательностей и позволил получить ряд новых форм рекомбинантных белков (1-CYS пероксиредоксин, ингибитор IL-13, олигопептидазы В). С помощью АНИС метода удалось выявить функциональные участки белков (IFN-g, HSP70, полипротеина gp181 бактериофага jKZ), исследовать механизмы функционирования белков (цитохром с, ряда гидролитических ферментов). Полученные результаты позволили обосновать концепцию мультицентрового фолдинга белков и сформулировать задачу проектирования полипептидных цепей с заданной пространственной организацией. При решении этой задачи в настоящий момент удалось выявить структуры определяющие пространственную структуру полипептидных цепей на ранних стадиях фолдинга и выявить новые уровни структурной организации белковых глобул.

Руководитель структурного подразделения: 1)
Зав. лаборатории ________________________  Долгих Дмитрий Александрович 
(должность)				(подпись)			    (ф.и.о.)
С отзывом ознакомлен:
Работник:
ст. н. сотрудник  	_______________________	   Некрасов Алексей Норбертович
(должность)				(подпись)			    (ф.и.о.)

1)	Отзыв на научного работника, являющегося руководителем научного подразделения, не входящего в состав основного научного подразделения, подписывается директором ИБХ РАН или уполномоченным им лицом

Форма 1
      
СПИСОК ТРУДОВ НАУЧНОГО РАБОТНИКА
за аттестационный период с «___»________ 2015г. по «___»________2020г.
Фамилия, имя, отчество научного работника: _Некрасов Алексей Норбертович _
Структурное подразделение: _Отдел биоинженерии___Лаб._инженерии_белка_

1. Наличие трудов научного работника по разделам:
№	Разделы 	Кол-во	
1.1	Публикации в рецензируемых журналах 	7	
1.2	Статьи в научных сборниках и продолжающихся научных изданиях	нет	
1.3	Монографии и главы в монографиях	нет	
1.4	Публикации в материалах научных мероприятий	11	
1.5	Патенты и свидетельства о регистрации программ для ЭВМ и баз данных	1	
1.6	Препринты	нет	
1.7	Научно-популярные книги и статьи	нет	
1.8	Другие публикации по вопросам профессиональной деятельности, учебники и учебно-методические пособия	нет	
2. Перечень трудов научного работника по соответствующим разделам1

1.1.	Публикации в рецензируемых журналах
1. Михайлова А.Г., Некрасов А.Н., Зинченко А.А., Ракитина Т.В., Корженевский Д.А., Липкин А.В., Разгуляева О.А., Овчинникова М.В., Горленко В.А., Румш Л.Д. 
"Укороченные варианты олигопептидазы В из Serratia proteamaculans с измененной активностью" Биохимия (2015) том 80, вып. 10, стр. 1606–1620.
DOI: 10.1134/S0006297915100156.

2. А.Н. Некрасов , А.А. Зинченко , Д.М. Карлинский , С.В. Козырев "Метод исследования иерархических элементов в природных аминокислотных последовательностях"  Успехи современного естествознания (2016) № 11 (часть 2), стр. 242-248. http://natural-sciences.ru/ru/article/view?id=36217

3. Chertkova R.V., Brazhe N.A., Bryantseva T.V., Nekrasov A.N., Dolgikh D.A., Yusipovich A.I., Sosnovtseva O., Maksimov G.V., Rubin A.B., Kirpichnikov M.P. "New insight into the mechanism of mitochondrial cytochrome c function" PLoS One (2017) vol. 12(5): e0178280. eCollection 2017.  
DOI: 10.1371/journal.pone.0178280. 

4. Alexei N. Nekrasov, Ludmila G. Alekseeva, Rudolf А. Pogosyan, Dmitry A. Dolgikh, M.P. Kirpichnikov, Alexandre G. de Brevern, Anastasia A. Anashkina "A minimum set of stable blocks for rational design of polypeptide chains" Biochimie (2019), vol. 160, pp. 88-92. DOI:  https://doi.org/10.1016/j.biochi.2019.02.006" \t 

5. В.В. Радченко, Е.В. Ильницкая, Т.М. Шуваева, М.В. Александрова, А.В. Лунева, Ю.А. Лысенко, Н.Ю. Басова, А.Н. Некрасов, А.Г. Кощаев  "Сравнительный анализ и пробиотический потенциал новых штаммов рода Lactobacillus из эволюционно закрепленых микробных ассоциаций желудочно-кишесного тракта дикой птицы"
Биофармацевтический журнал (2020) том 12, номер 1, стр. 25–30.
DOI: 10.30906/2073-8099-2020-12-1-25-30

6. . A.I. Mikhalskii, I.V. Petrov, 1 V.V. Tsurko, A.A. Anashkina, A.N. Nekrasov
“Application of mutual information estimation 3 for predicting the structural stability of 4 pentapeptides” Russian Journal of Numerical Analysis and Mathematical Modelling (2020) vol.35, No.5, pp.263-271.

7. А.Н. Некрасов, Ю.П. Козмин, С.В. Козырев, Н.Г. Есипова, Р.Х. Зиганшин, А.А. Анашкина "Уровни иерархзической организации белковых последовательностей. Анализ энтропийных характеристик"  Биофизика (2020) том 65, номер 3.

1.2. Статьи в научных сборниках и продолжающихся научных изданиях

нет

1.3. Монографии и главы в монографиях

нет

1.4. Публикации в материалах научных мероприятий

1. Некрасов Алексей Норбертович, Зинченко Алексей Алексеевич "Дизайн рекомбинантных белков. Новый подход" VIII Московский международный конгресс "Биотехнология: состояние и перспективы развития" Москва 17-20 марта 2015 стр. 38

2. Карлинский Давид Михайлович, Зинченко Алексей Алексеевич, Некрасов Алексей Норбертович "Устойчивость иерархической организации белковых последовательностей выявляемых методом АНИС" V съезд биофизиков Росии 4-10 октября 2015 г.  Ростов на Дону, Южный Федеральный Университет Материалы докладов том 2, стр. 16

3. Некрасов Алексей Норбертович, Зинченко Алексей Алексеевич "Новая парадигма структурной организации белков" V съезд биофизиков Росии 4-10 октября 2015 г. Ростов на Дону, Южный Федеральный Университет Материалы докладов том 2, стр. 21

4. Зинченко А.А., Прокопенко Ю.А., Котельникова О.В., Аллилуев А.П., Гордеева Е.А., Калиберда Е.Н., Мелихова Т.Д., Некрасов А.Н., Нокель Е.А., Румш Л.Д. "IgA1 протеаза N. Meningitidis. Поиск и создание рекомбинантных белковых фрагментов с потенциальным протективным действием" Научные труды V съезд физиологов СНГ. V съезд биохимиков России. Сочи – Дагомыс, Россия 4–8 октября 2016. Acta Naturae (2016) Спецвыпуск Т. 2, с. 37

5. Карлинский Д.М., Зинченко А.А., Румш Л.Д., Некрасов А.Н. "Моделирование пространственной структуры белков путем совместного использования методов молекулярной динамики и молекулярного докинга" Научные труды V съезд физиологов СНГ. V съезд биохимиков России. Сочи – Дагомыс, Россия 4–8 октября 2016 Acta Naturae (2016) Спецвыпуск Т. 2, с. 82.

6. Anastasia Anashkina, Alexei Nekrasov "Bioinformatics Basis for the “Molecular Tweezers" Construction" Belgrade Bioinformatics Conference BELBI2016 Belgrade Serbia 20-24 June, 2016 Book of Abstracts p. 41-44

7. Некрасов А.Н.,  Анашкина А.А. "Новая парадигма структурной организации белков. I. Как организованы белковые молекулярные машины" Международная научная конференция "Молекулярные, мембранные и клеточные основы функционирования биосистем" Белоруссия, Минск, 28-30 июня 2016г. Сборник статей в двух частях Часть 1 стр. 146-149

8. Некрасов А.Н., Зинченко А.А."Новая парадигма структурной организации белков. II. Дизайн белковых молекулярных машин – Теория и практика" Международная научная конференция "Молекулярные, мембранные и клеточные основы функционирования биосистем" Белоруссия, Минск, 28-30 июня 2016г. Сборник статей в двух частях Часть 1 стр. 150-153

9. Anastasia Anashkina, Alexei Nekrasov "The hierarchy in the natural protein sequences and it's applications", International conference New Trends in Mathematical and Theoretical Physics, 03–07 October 2016, Moscow, Russia.  http://www.mathnet.ru/eng/present14928

10. Некрасов А.Н., Козмин Ю.П., Козырев С.В., Анашкина А.А."Уровни организации структурных доменов белков"  VI Съезд биофизиков России Сочи 16-21.09.2019 Сборник научных трудов том.1. стр.45-46

11. Некрасов А.Н., де Бреверн A.Г., Анашкина А.А."Минимальный набор стабильных блоков полипептидной цепи"VI Съезд биофизиков России Сочи 16-21.09.2019 Сборник научных трудов том.1. стр.46-47

1.5. Патенты и свидетельства о регистрации программ для ЭВМ и баз данных

Анашкина А.А., Рогов С.И., Козьмин Ю.П., Некрасов А.Н. "Программа для кластеризации конформационных состояний аминокислотных остатков и фрагментов полипептидной цепи (пептидов) по значениям торсионных углов (Condense) " Регистрационный номер в ФАП СО РАН: PR19003 Дата регистрации в ФАП СО РАН: 2019-06-18
https://fap.sbras.ru/node/5037

1.6. Препринты

нет

1.7. Научно-популярные книги и статьи

нет

1.8. Другие публикации по вопросам профессиональной деятельности

нет

Научный работник:
(должность)	ст. н. сотрудник                         (подпись) Некрасов Алексей Норбертович (ф.и.о.)
Руководитель структурного подразделения:
(должность)	Зав. лаборатории                                         (подпись) Долгих Дмитрий Александрович (ф.и.о.)
1С приложением копии первой страницы труда
Форма 2

СПИСОК ГРАНТОВ, НАУЧНЫХ КОНТРАКТОВ, ДОГОВОРОВ, В ВЫПОЛНЕНИИ КОТОРЫХ УЧАСТВОВАЛ НАУЧНЫЙ РАБОТНИК С УКАЗАНИЕМ ЕГО КОНКРЕТНОЙ РОЛИ
за аттестационный период с «___»________ 2015г. по «___»________2020г.

Фамилия, имя, отчество научного работника:  Некрасов Алексей Норбертович 
Структурное подразделение:  Отдел биоинженерии       Лаб. инженерии белка 

Номер 
гранта, программы / контракта / 
договора	Тема, предмет
гранта, программы / контракта / 
договора	Срок
(период)
действия гранта, программы / контракта / 
договора	Статус участия (руководитель, исполнитель)	Функции, выполняемые научным работником
(его конкретная роль)	
1. Гранты, программы:	
Программы № 43 фундаментальных исследований Президиума РАН по стратегическим направлениям развития науки	«Математическая модель пространственной организации природных полипептидных цепей на основе информационного контента первичной структуры»	2014 - 2017 г.	отв. исполнитель	Постановка исследов. задач. Разработка алгоритмов и программ. Отладка и тестирование программ. Выполнение расчетов. Анализ данных. Написание отчета.	
					
2. Контракты, договоры:	
нет					

Научный работник:
(должность)	ст. н. сотрудник                         (подпись)	 Некрасов Алексей Норбертович (ф.и.о.)
Руководитель структурного подразделения:
(должность)	Зав. лаборатории                                         (подпись) Долгих Дмитрий Александрович (ф.и.о.)
Форма 3

СВЕДЕНИЯ О ЛИЧНОМ УЧАСТИИ НАУЧНОГО РАБОТНИКА В НАУЧНЫХ МЕРОПРИЯТИЯХ
за аттестационный период с «___»________ 2015г. по «___»________2020г.
Фамилия, имя, отчество научного работника:   Некрасов Алексей Норбертович
Структурное подразделение: Отдел биоинженерии       Лаб. инженерии белка

Вид1) и наименование (тема) научного мероприятия	Статус доклада2) 
	Уровень мероприятия3)
	Тема доклада 
	Дата и место проведения 
	Документ, подтверждаю-
щий участие4) 
	
конгресс 	пленарный	международный 	Дизайн белков. 	Москва 17-20 марта 2015	Программа конгресса (скан страницы в файле ModBioTechWorld_2015.jpg)	
съезд 	секционный	всеросийский	структурной организации белков	Ростов на Дону 4-10 октября 2015 г.	Программа съезда (скан страницы в файле RND_2015_001.jpg)	
конференция	пленарный	международная	Взаимодействия в полипептидных цепях	Белград 20-24 июня 2016	http://alas.matf.bg.ac.rs/~websites/bioinfo/	
конференция	пленарный	международная	Исследование уровней организации белковых последовательностей	Москва 3-7 октября 2016	http://www.mathnet.ru/eng/conf791	

Пояснения:
1) Вид мероприятия – съезд, конференция, симпозиум или иное научное мероприятие (указать какое конкретно).
2) Статус доклада – приглашенный, пленарный, секционный, стендовый.
3) Уровень мероприятия – международное, всероссийское, региональное.
4) Допускается подтверждение руководителем структурного подразделения (подпись).
Научный работник:
(должность)	ст. н. сотрудник                         (подпись)	 Некрасов Алексей Норбертович (ф.и.о.)
Руководитель структурного подразделения:
(должность)	Зав. лаборатории                                         (подпись) Долгих Дмитрий Александрович (ф.и.о.)
Форма 5

СВЕДЕНИЯ О ПЕДАГОГИЧЕСКОЙ ДЕЯТЕЛЬНОСТИ
НАУЧНОГО РАБОТНИКА
за аттестационный период с «___»________ 2015г. по «___»________2020г.

Фамилия, имя, отчество научного работника: Некрасов Алексей Норбертович
Структурное подразделение:  Отдел биоинженерии     Лаб. инженерии белка

Вид педагогической деятельности и место ее осуществления 
	Наименование (тематика) конкретного вида педагогической деятельности	Период осуществления конкретного вида педагогической деятельности	Документы, подтверждающие сведения 
	
1. Чтение курсов лекций:	
Чтение лекций, МГУ им. М.В. Ломоносова	Инженерия белка	2015-2019		
				
2. Проведение семинаров:	
нет				
				
3. Научное руководство аспирантами:	
нет				
				
4. Другие виды педагогической деятельности1):	
нет				

Пояснения:
1) Могут указываться любые виды педагогической деятельности научного работника, не включенные в вышеприведенные разделы.

Научный работник:
(должность)	ст. н. сотрудник                                       (подпись)	 Некрасов Алексей Норбертович (ф.и.о.)
Руководитель структурного подразделения:
(должность)	Зав. лаборатории                                         (подпись) Долгих Дмитрий Александрович (ф.и.о.)