Ретроэлементы (RE) составляют значительную часть (до 50%) генома человека. RE несут в себе большое количество различных регуляторных элементов и  способны перемещаться по геному при помощи ретротранспозиции. Ретроэлементы способны оказывать влияние как на экспрессию близлежащих генов, так и на функционирование генома в целом. В геноме человека обнаружено большое количество интеграций RE, полиморфных в различных человеческих популяциях. Полиморфные интеграции ретроэлементов все шире используются в качестве молекулярно-генетических маркеров (МГМ) в популяционно- и медико-генетических исследованиях, например для определения генетических взаимоотношений между отдельными популяциями или ассоциативного анализа интеграционного полиморфизма с развитием некоторых заболеваний. МГМ на  основе RE обладают рядом преимуществ: 1) присутствие инсерции ретроэлемента в данном геномном локусе всегда говорит об общем происхождении, так как вероятность независимой интеграции RE в точно такое же место генома исчезающе мала; 2) инсерции RE, как правило, достаточно стабильны, так как в  геноме не существует специального механизма для бесследного удаления интеграций; 3) из всех известных типов полиморфизмов инсерционная вариабельность ретроэлементов наиболее легко детектируется экспериментально.

PRED — это первый общероссийский интернет ресурс посвященный полиморфным ретроэлементам (RE) человека — молекулярно-генетическим маркерам нового поколения. Данный интернет ресурс позволяет проводить поиск молекулярно-генетических маркеров необходимых для проведения популяционно-генетических и медико-биологических исследований широкого профиля. ВНИМАНИЕ!!! Данная версия ресурса является демонстрационной и дает возможность скачать базу данных и поисковую программу.

PRED позволяет проводить поиск полиморфных ретроэлементов, обладающих характеристиками необходимыми исследователю. К таким характеристикам относятся нуклеотидная последовательность, положение ретроэлемента в геноме человека, частота его встречаемости в исследованных человеческих популяциях, информация о ближайших генах и их взаимное расположение. Кроме того, в базе данных имеется подробная информация по каждому отдельно взятому ретроэлементу и ссылка на работу, в которой впервые была опубликована информация о полиморфизме RE.

Здесь содержится доступная для скачивания база данных по известным полиморфным ретроэлементам, а также программа позволяющая проводить поиск по базе данных. Обратите внимание, что для функционирования программы вам понадобится приложение Microsoft.NET Framework Version 2.0 доступное (бесплатно) через Интернет на сайте корпорации Майкрософт.
Скачать Microsoft.NET Framework Version 2.0.