Лаборатория биоинформационных методов комбинаторной химии и биологии

Отдел функционирования живых систем

Руководитель: Баранов Павел Викторович, к. х. н.

биоинформатика, геномика, анализ последовательностей, рибосомное профилирование, масс спектрометрия, предсказание белковых структур, микробелки, протеоформы

Лаборатория была создана в 2019 году. Лаборатория занимается анализом и обработкой высокопропускных геномных и пост-геномных данных (полнотранкриптомное секвенирование, рибосомное профилирование, масс спектрометрические данные) для обнаружения новых белок-кодирующих последовательностей и изучения функциональных свойств их продуктов. Для этих целей лабораытория также использует филогенетические подходы и моделирование структур белковых молекул.

 

Лаборатория тесно сотрудничает с лабораторией ЛАПТИ в г. Корк, Ирландия.

 

 

 

 

- Изучение механизмов регуляции генной экспрессии и белкового синтеза.

- Oбнаружение и изучение транслируемых участков геномов и транскриптомов, включая кодирующие новые белки и протеоформы.

- Изучение природного разнообразие генетического декодирования. 

- Разработка програмного обеспечения для анализа биологических данных.

- Разработка вычислительных методов для поиска новых биоактивных молекул на основе скрининга комбинаторных пептидных библиотек.

- Молекулярное моделирование белковых структур и пептид-белковых взаимодействий.

Был обнаружен и охарактеризован POLGARF, продукт не-АУГ инициируемой трансляции открытой рамки считывания перекрывающейся с белок кодирующей последовательностью гена POLG кодирующего митохондриальную ДНК полимеразу (Loughran et al doi: 10.1101/2020.03.06.980391).

Все публикации (показать избранные)

Загружаются...

Баранов Павел Викторович

  • Москва, ул. Миклухо-Маклая, 16/10 — На карте
  • ИБХ РАН, корп. , комн.

bimcocheb@gmail.com