Лаборатория молекулярного дизайна и синтеза

Отдел функционирования живых систем

Руководитель: Коршун Владимир Аркадьевич

биоконъюгация, нуклеиновые кислоты, флуоресцентные красители, Синтетические методы органической химии, антигены, гаптены, флуоресцентные метки, нетрадиционные аминокислоты, полиазамакроциклы, хромофорные соединения, ионные жидкости, природные низкомолекулярные соединения

  • Получение веществ с противовирусной активностью.
  • Создание флуоресцентных ДНК-зондов.
  • Разработка олигонуклеотидных конъюгатов в качестве блоков для ДНК-наноструктур.
  • Создание масс-спектрометрических меток для детекции биомолекул.
  • Разработка инновационных методов синтетической органической химии и принципиально новых схем синтезов органических соединений
  • Практическое получение соединений различных классов: бензогетероциклов, арилсульфамидов и арилсульфоновых кислот, полициклических и каркасных соединений, арилборных кислот, продуктов деградации лекарственных веществ, антигенов и гаптенов, флуоресцентных меток, нетрадиционных аминокислот, спин-меченых аминокислот, хромофорных и фотосенсибилизирующих соединений, природных низкомолекулярных соединений.
  • Обнаружено образование межцепочечного пиренового эксимера в большой бороздке ДНК (ChemBioChem, 2003, 4:841).
  • В качестве улучшенной эксимеробразующей флуоресцентной метки для нуклеиновых кислот предложен 1-фенилэтинилпирен (Nucleosides Nucleotides, 1997, 16:1461; Eur. J. Org. Chem., 2004, 1298; Bioconjugate Chem., 2007, 18:1972), использованный в различных типах ДНК-зондов (Mutation Res., 2006, 599:144; Meth. Mol. Biol., 2009, 578:209; Chem. Eur. J., 2008, 14:11010; Chem. Commun., 2010, 46:8362; Bioconjugate Chem., 2011, 22:533; Analyst, 2016, 141:1331).
  • Впервые был применен метод прямого присоединения флуоресцентной метки к нуклеиновому основанию с помощью тройной связи (Биоорган. химия, 1996, 22:923; ChemBioChem, 2006, 7:810). Среди таких соединений обнаружен новый класс противовирусных нуклеозидов, активных по отношению к вирусам простого герпеса тип 1, гриппа, гепатита С, клещевого энцефалита и другим вирусам, имеющим липидную оболочку (Биоорган. химия, 2003, 29:289; Вопросы вирусологии, 2006:34; Tetrahedron, 2006, 62:1279; Org. Biomol. Chem., 2006, 4:1091; PNAS USA, 2010, 107:17339; J. Virol., 2013, 87:3640; Med. Chem. Commun., 2016, 7:495).
  • Разработаны новые масс-спектометрические метки (Org. Biomol. Chem., 2008, 6:4593; Масс-спектрометрия, 2015, 12:253; Analyst, 2016, 141:3289) и на их основе предложен метод детекции однонуклеотидного полиморфизма с помощью MALDI масс-спектрометрии (Anal. Chem., 2008, 80:2342; Meth. Mol. Biol., 2009, 578:345) и метод анализа аминогликозидных антибиотиков (Acta Naturae, 2016, 8:128).
  • Изучено применение реакции циклоприсоединения азидов и алкинов для получения конъюгатов ДНК (Биоорган. химия, 2010, 36:437), в том числе блоков для сборки ДНК-наноструктур (Изв. АН, Сер. хим., 2006:1220; Tetrahedron, 2008, 64:1467; Chem. Commun., 2013, 49:511; Org. Lett., 2014, 16:4590; Tetrahedron, 2016, 72:2386) и эффективных ДНК-зондов для ПЦР в режиме реального времени (Anal. Bioanal. Chem., 2012, 404:59; Analyst, 2014, 139:2867; Analyst, 2016, 141:1331; Anal. Meth., 2016, 8:5826; Mol. Cell. Probes, 2016, 30:285).
  • Синтезированы компоненты олигопептидных ингибиторов Plm II протеаз – ω-гидроксизамещенных L-α-аминокислот.
  • Разработан новый препаративный метод синтеза аргиопина, синтезировано 100 г. этого природного токсина. Найденный метод использовался в синтезе аналогов аргиопина.
  • Разработаны эффективные методы синтеза и получен представительный набор замещенных 2-тиазолил-1-алкил(арил)этанолов, перспективных шаблонов для получения новых фармакологических препаратов.
  • Разработаны синтетические схемы и проведен синтез гаптенов, необходимых компонентов в иммуноферментном анализе токсичных компонентов бытовых моющих средств, загрязняющих окружающую среду, современных пестицидов и антибиотиков.
  • Разработаны методы синтеза и получен фотопереключаемый фрагмент белка для создания управляемых элементов вторичной структуры; фотоактивируемые метки для исследования рецепторных систем; флуоресцентные метки для исследования строения и функционирования нуклеиновых кислот; фотосенсибилизирующие реагенты; флуоресцентные индикаторы.
  • В рамках Программ Президиума РАН «Происхождение и эволюция биосферы» проведен анализ с использованием методов компьютерного синтеза вариаций абиогенных условий образования аденина, а также конденсации аденина с рибозой и рибозофосфатом; сформирована библиотека моносахаридов, разработаны методики их определения методами хромато-масс-спектрометрии и ГЖХ.
  • Найден новый подкласс модифицированных нуклеозидов, обладающих высокой активностью в отношении оболочечных вирусов (см. рис. ниже). Cреди обнаруженного нами ранее (Биоорган. химия, 29 (3), 289–294 (2003), Nucleosides, Nucleotides & Nucleic Acids, 24(5/7), 923–926 (2005), Tetrahedron, 62 (6), 1279–1287 (2006), Вопросы вирусологии, 2006 (1), 34–38, Org. Biomol. Chem.,4 (6), 1091–1096 (2006)) класса противовирусных соединений выявлена группа веществ с высокой активностью в отношении оболочечных вирусов. В частности, IC50 5-(перилен-3-ил)этинил-2′-дезоксиуридина составляет 50 нмоль/л для вируса простого герпеса типа 1 и 180 нмоль/л для вируса гепатита C. Характерной особенностью структуры активных нуклеозидов является присутствие остатка пентациклического ароматического углеводорода перилена, жестко присоединенного к нуклеиновому основанию с помощью тройной связи. Высказано предположение, что уникальная структура полученных соединений обусловливает их встраивание в оболочку вириона, в результате чего слияние вириона с клеткой (инфицирование) становится весьма невыгодным процессом. Новые соединения практически не цитотоксичны.

ФИОДолжностьКонтакты
Коршун Владимир Аркадьевич, д.х.н.г.н.с.v-korshun@yandex.ru, +7(499)724-67-15
Михура Ирина Владиславовна, к.х.н.с.н.с.
Прохоренко И.А., к.х.н.с.н.с.
Тюрин Антон Павловичс.н.с.anton2rin@gmail.com
Устинов А.В., к.х.н.с.н.с.
Алферова Вера Александровнан.с.alferovava@gmail.com, alferova@ibch.ru
Брылёв Владимир Анатольевичм.н.с.
Гуляк Е.Л.м.н.с.
Сапожникова Ксения Андреевнам.н.с.
Чистов Алексей Александровичм.н.с.
Баранова А.А.инж.-иссл.
Верютин Д.А.инж.-иссл.
Кравченко Татьяна Валерьевнаинж.-иссл.
Берсенев Е.А.тех.-лаб.
Ганжула Е.П.тех.-лаб.
Красильников М.С.тех.-лаб.
Мариевская К.А.тех.-лаб.
Мисатюк Ф.С.тех.-лаб.
Михайлова А.С.тех.-лаб.
Михновец Игорь Эдуардовичтех.-лаб.
Никитин Т.Д.тех.-лаб.
Овчаренко А.А.тех.-лаб.
Орешков Сергей Денисовичтех.-лаб.
Цыкина К.А.тех.-лаб.
Тюрина Е.С.инженер

Ранее здесь работали

Формановский А.А., д.х.н.
Апарин Илья Олегович, к.х.н.
Попова Инна Станиславовна, к.х.н.
Семенов А.В.
Степанова И.А.
Копнин И.П.
Ножевникова Елена Викторовна
Проскурин Г.В.
Беляева М.А.
Берлина Я.Ю.
Докукин Ю.С.
Зайцева Д.С.
Кокин Е.А.
Корельская К.С.
Мещеряков Н.В.
Мясоутова А.А.
Скоморохова Е.С.
Стрешнев Ф.П.
Стрижевская Д.А.
Цыгольник Д.А.
Волков Т.М.
Кононенко Н.Е.
Мелешкина Е.Г.
Слесарчук Н.А.
Старых С.А.
Хайруллина Р.А.
Чадин А.А.
Иванов Н.М.
Орлов А.А.
Топольян А.П.
Хватов Е.В.
Загрузка...
Загрузка...

Коршун Владимир Аркадьевич

Москва, ул. Миклухо-Маклая, 16/10 — На карте

v-korshun@yandex.ru

+7(499)724-67-15

Загрузка...