Группа молекулярных инструментов для исследования живых систем

Отдел функционирования живых систем

Руководитель: Аралов Андрей Владимирович

РНК, ДНК, G-квадруплекс, i-мотив, антисмысловые олигонуклеотиды, зонды, pH сенсоры, модификация, флуоресценция

Основные направления исследований группы включают:

  • дизайн и синтез нуклеотидных модификаций для регулирования свойств канонических и неканонических вторичных структур нуклеиновых кислот; 
  • разработку нуклеотидных модификаций, пригодных в антисенс- и RNAi технологиях;
  • синтез и скрининг зондов/лигандов для детекции и изменения физико-химических параметров неканонических вторичных структур нуклеиновых кислот;
  • разработку и исследование свойств олигонуклеотидных модификаций, связывающихся с ионами металлов;
  • исследование физико-химических свойств модификаций, возникающих в живых организмах под воздействием мутагенных факторов окружающей среды;
  • дизайн и синтез противовирусных соединений.

Неканонические структуры ДНК широко применяются для регуляции экспрессии генов, в ДНК нанотехнологии и в разработке сенсоров на основе ДНК. В частности, особое внимание в последнее время уделяется I-мотивам, которые представляют собой два интеркалированных параллельных дуплекса, удерживаемых вместе за счет образования гемипротонированных пар цитозин-цитозин. Поскольку образование данных пар и, соответственно, i-мотивов происходит в достаточно узком диапазоне pH (3.0-6.5), существует необходимость в инструментах, позволяющих осуществлять «тонкую настройку» свойств данных неканонических структур.

Мы осуществили рациональный дизайн новой замещенной феноксазиновой модификации и исследовали ее свойства в составе модельных и геномных последовательностей, способных образовывать i-мотивы. Было показано, что включение данной модификации обеспечивает значительную термическую стабилизацию и также позволяет изменять значение pH перехода, представляющего собой важный параметр, например, при дизайне pH сенсоров и зондов для детекции низкомолекулярных лигандов, катионов и белков. Результаты исследования опубликованы в журнале Nucleic Acids Research (10.1093/nar/gky121).

ФИОДолжностьКонтакты
Аралов Андрей Владимирович, к.х.н.с.н.с.
Камзеева П.Н.тех.-лаб.
Хрулев Алексей Анатольевичинженер
Загрузка...
Загрузка...

Аралов Андрей Владимирович

Москва, ул. Миклухо-Маклая, 16/10 — На карте

Загрузка...