Ширшиков Фёдор Владимирович

Личная информация

Получил высшее образование в Казанском федеральном университете, который закончил с дипломом микробиолога. В качестве специализации на старших курсах выбрал молекулярную биологию. Студентом вне учебной программы освоил ряд методов биоинформатики, что нашло применение в моих курсовых работах и дипломном проекте.

Главным увлечением остаются биологические науки и органическая химия, но ещё я люблю кататься на горном велосипеде, изучаю типографику и графический дизайн. Умею вручную переплетать и реставрировать книги. Около шести лет занимался в секции бокса. Учился в средней образовательной школе № 43 в Казани и там же закончил детскую художественную школу № 2. Свободное время посвящаю плёночной фотографии в стиле «Ломография».

Читайте заметку обо мне на научно-популярном сайте «Теории и практики Москвы». В этой небольшой статье рассказывается о том, как я начал заниматься биологией, а также об основных научных результатах, полученных во время студенчества. Текст этой заметки будет интересен тем, кто хочет узнать о пользе применения биоинформатики для разработки противоопухолевых препаратов на основе рибонуклеаз.

Образование

Период обученияСтрана, городУчебное заведениеДополнительная информация
2007–2012 Россия, Казань Казанский университет Диплом микробиолога с отличием

Научные интересы

Сфера моих научных интересов касается микробиологии, молекулярной биологии и структурной биоинформатики. Особый интерес для меня представляет работа на стыке теоретических и экспериментальных исследований.

В настоящее время занимаюсь разработкой способов молекулярной диагностики фитопатогенов на основе метода петлевой изотермической амплификации.

Премии и заслуги

  • Специальная государственная стипендия Правительства Российской Федерации;
  • Специальная государственная стипендия Республики Татарстан;
  • Почётная стипендия имени М. И. Беляевой для микробиологов Казанского университета.

Основные научные результаты

  • Создание первого в мире набора праймеров для детекции бактериальных патогенов картофеля из рода Dickeya на основе метода петлевой изотермической амплификации (LAMP). Набор праймеров запатентован на территории Российской Федерации (патент на изобретение № 2642313);
  • Разработка программного обеспечения для подбора гена-мишени и последующего дизайна специфических праймеров на основе множественного выравнивания ортологичных нуклеотидных последовательностей;
  • Открытие нового геномовида фитопатогенных бактерий на основе методов сравнительной геномики, способных существовать в ассоциативном симбиозе с плодовыми мушками рода Drosophila. Новый геномовид назван "Candidatus Pectobacterium maceratum" по основному симптому, который вызывают бактерии мокрой гнили, а именно мацерация растительной ткани;
  • Предсказание существования спирального гидрофобного сегмента у некоторых секретируемых рибонуклеаз, обладающих противоопухолевой активностью;
  • Объяснение механизма димеризации биназы в водном растворе;
  • Создание принципиально новой модели цитотоксичности рибонуклеаз с гидрофобным сегментом, включающей в себя механизм выхода рибонуклеаз из эндосом, и предлагающей в качестве внутриклеточной мишени действия рибонуклеаз внешнюю мембрану митохондрий, увеличение проницаемости которой при действии гидрофобного сегмента служит ключевым фактором в инициации апоптоза опухолевой клетки.

Членство в научных обществах

  • Российское общество биохимиков и молекулярных биологов РАН;
  • Федерация европейских биохимических обществ;
  • Совет молодых учёных ИБХ РАН.

Избранные публикации (показать все)

Загружаются...