Флуоресцентная система на основе аптамера Манго позволяет отслеживать малую некодирующую РНК бактерий в инфицированных макрофагах
Сотрудники ИБХ РАН с коллегами из ФНКЦ физико-химической медицины и других российских институтов разработали платформу для флуоресцентной визуализации малых некодирующих РНК (мнРНК) в живых клетках. Система состоит из флуорогенного цианинового красителя и генетически кодируемой метки на основе аптамера Манго II, которая присоединяется к исследуемой мнРНК и вызывает усиление флуоресценции при связывании с красителем. В работе предложен подход к оптимизации спектральных свойств красителей и разработана минимальная генетически кодируемая метка (52 но) для визуализации мнРНК. Применимость разработанной платформы продемонстрирована на примере визуализации мнРНК Mycobacterium tuberculosis в бактериях и инфицированных бактериями макрофагах. Работа опубликована в журнале Nucleic Acids Research.
26 февраля 2023 года