Int J Mol Sci, 2026, 27(18):8153

A Pan-Cancer Analysis of microRNA Tissue Specificity and Its Association with Dysregulation

MicroRNAs are frequently dysregulated in cancer, yet how their tissue specificity is remodeled during malignant transformation remains poorly characterized. Here, we systematically quantified the tissue specificity of miRNAs across normal (GTEx) and cancer (TCGA) tissues using the Tau index as the primary metric and the Gini index for independent validation. Our analysis revealed a negative association between tissue specificity in healthy tissues and changes in specificity during malignant transformation, indicating that miRNAs with higher tissue specificity in normal tissues tend to undergo greater loss of specificity in cancer. To robustly define dysregulation, we combined two independent analyses: a binomial test over per-project differential expression across 17 matched normal tissues within the TCGA cohort, and a TCGA-GTEx pan-tissue comparison of mean expression. The change in specificity (ΔTau) separated up- from downregulated miRNAs, showing moderate agreement with the binomial signal and a strong correlation with the expression-based contrast. Finally, we identified six miRNAs that lose tissue specificity upon transformation while remaining consistently upregulated (miR-519a-5p, miR-512-3p, miR-522-3p, miR-105-5p, miR-935, miR-1269a). Functional analysis of their experimentally validated and predicted targets showed significant enrichment for converging on core oncogenic programs. Collectively, integrating specificity dynamics with dysregulation evidence pinpoints candidate miRNAs with coordinated, cancer-relevant regulatory roles and highlights those with favorable tissue-specificity profiles that may warrant further investigation as potential therapeutic candidates.

Ismailov A, Belogurov A, Evpak A, Poptsova M

IBCH: 12764
Ссылка на статью в журнале: https://www.mdpi.com/1422-0067/27/18/8153
Кол-во цитирований на 10.2026: 0
Данные статьи проверены модераторами 2026-10-11

Список научных проектов, где отмечена публикация

  1. Онкотераностика и проблемы резистентности к противоопухолевым и антибактериальным препаратам (23 Апреля 2024 года — 31 Декабря 2026 года). Деев С.М., Алексеева Н.А., Алексеева Л.Г., Алипер Е.Т., Алферова В.А., Андрианова А.Г., Бабкова Ю.С., Баранова А.А., Баранова М.Н., Белогуров А.А., Богачук А.П., Бочаров Э.В., Буренина О.Ю., Бычков М.Л., Веретененко И.И., Волков Д.В., Габибов А.Г., Гордеева В.Д., Горелик Л.В., Грязнова О.Ю., Гуляк Е.Л., Дерябин А.С., Доброчаева К.Л., Евпак А.С., Егорова Н.С., Емельянов Е.А., Ермолаева Е.О., Ефремов Р.Г., Житлов М.Ю., Жучков В.А., Захарова М.Ю., Звягин А.В., Зелепукин И.В., Зинченко А.А., Калганова А.И., Кириченко А.В., Кирпичников М.П., Кнорре В.Д., Ковалева Д.К., Коваленко Е.И., Кокаева И.С., Коновалова Е.В., Коншина А.Г., Короткова Н.А., Коршун В.А., Котельникова О.В., Котельникова П.А., Кравченко Т.В., Крылов Н.А., Кудряева А.А., Кузьмина О., Курбацкая И.Н., Лазарев И.В., Логвинов А.С., Люкманова Е.Н., Мазур Р.В., Маллаев Р.А., Соболева (Мирзоева) Н.З., Миркасымов А.Б., Мусатова О.Е., Нечаева А.М., Никитин Т.Д., Никонова А.В., Нольде Д.Е., Оджомоко Л.О., Орлова Д.А., Панина И.С., Пахомов А.А., Пахомова Т.Е., Пижонков Н.А., Пипия С.О., Полянский А.А., Похоруков Д.А., Прокопенко Ю.А., Прошкина Г.М., Родионов В.И., Ротанова Т.В., Рубцов Ю.П., Рябуха Я.А., Саватеева Н.С., Сапожникова К.А., Серова Е.В., Синичич А.А., Смирнов И.В., Согомонян А.С., Спаллоне А., Степанова (Украинская) В.М., Стрельцова М.А., Сутугин Ю.А., Терехов С.С., Фролова А.Ю., Хаврошечкина Е.В., Ходарович Ю.М., Холоденко Р.В., Цетлин В.И., Чумаков С.П., Шилова П.А., Шлепова О.В., Шрамова Е.И., Шульга А.А.. Грант, Бюджетное финансирование.