Лаборатория молекулярной диагностики
Лаборатория молекулярной диагностики была образована в 2015 году на основе группы молекулярной диагностики, существующей в ИБХ РАН с 2005 года (до 2005 г - группы фитоиммунодиагностики). Основные направления работы лаборатории - разработка иммунохимических диагностических тест-систем для диагностики различных патогенов растений (вирусов, бактерий, грибов), а также работа в области фундаментальных исследований вирусов растений и молекулярной биологии растений
- Разработка систем ПЦР-диагностики и идентификации различных патогенов растений и животных (вирусы, бактерии, грибы, нематоды и др.)
- Оптимизация методов выделения ДНК и РНК для анализа материала растительного и животного происхождения и идентификации микроорганизмов
-
Изучение генетического разнообразия и молекулярных механизмов патогенеза токсигенных грибов рода Fusarium. Поиск новых высокоспецифических ДНК-маркеров.
-
Разработка и оптимизация новых подходов для детекции биомолекул, представленных в сверхмалых концентрациях, на основе метода иммуно-ПЦР.
- Генная инженерия растений
- Использование ПЦР-технологий для быстрой оценки эффективности регуляторов роста растений
- Изучение структуры, внутриклеточной локализации и функций нового класса фитопептидов семейства miPEP156, кодируемых предшественниками микро-РНК.
- Изучение гомологов вирусных белков, закодированных в геноме ретротранспозонов семейства R1 LINE у насекомых.
- Получение поли- и моноклональных антител
- Разработка иммунохимических тест-систем
Основными методами исследований являются генно-инженерные и иммунохимические методы, а также ДНК-технологии. Часть исследований проводится в сотрудничестве с другими подразделениями ИБХ РАН, НИИ им. Белозерского МГУ, ЗАО «ДНК-технологии», Институтом фитопатологии РАСХН и рядом зарубежных Институтов и фирм.
Гранты и проекты
1.Грант РФФИ № 06-04-48211а,2006–2008 гг. «РНК-репликаза клостеровируса желтухи свеклы: протеолитический процессинг белка-предшественника, зрелые компоненты репликативных комплексов и их цитопатогенные эффекты»
2.Грант РФФИ № 06-04-49129а,2006–2008 гг. «Изучение путей и механизмов транслокации белков через плазмодесмы на модели транспортных белков фитовирусов»
3.Проект МНТЦ № 3721p 2007–2010 гг. Идентификация молекулярными методами фитопаразитических нематод из Национальной Российской Коллекции Нематод, создание электронной базы данных молекулярных, морфологических и других характеристик фитонематод, создание исследовательской группы молекулярной диагностики нематод (совместно с ВНИИФ)
4.Грант Европейского Сообщества FP6 № 037212 (LSHB-CT-2006-037212) 2006–2009 гг. «Разработка новых и рентабельных методов неинвазивной диагностики патогенных микроорганизмов человека».
5.Госконтракт «Разработка биочипа и тест-систем для определения белковых токсинов, включая стафилококковые энтеротоксины, и антидота против ботулинического нейротоксина А, а так же ПЦР-тест систем для выявления ряда значимых патогенов растений» (Шифр «Биопатоген-ИБХРАН») по Договору № 34–405/07 от 5.10.2007. в рамках Государственного контракта №ГП/07/538/НТБ/К от 11.09.2007 г. ФЦП «Национальная технологическая база» на 2007–2011 гг.
6.Грант РФФИ 11-04-01493-а. «Съедобные вакцины против аллергии: изучение механизмов индукции толерантности мукозальными вакцинами на основе рекомбинантных белков клещей домашней пыли Dermatofagoides farina Der f 1 и Der f 2, полученных в листьях табака». 2011-2013 гг.
7. Грант РФФИ 11-04-00767-а. «Изучение динамики экспрессии генов, кодирующих антимикробные пептиды ежовника обыкновенного (Echinochloa crusgalli L.) под воздействием абиотических и биотических стрессов». 2011-2013 гг.
8. Госконтракт «Разработка опытно-промышленной технологии производства тест-систем на основе иммуно-ПЦР и мультиплексного флуоресцентного иммуноанализа, проведение медицинских испытаний и подготовка досье для государственной регистрации», 2010-2013 гг.
9. СЧ НИР "Исследования по созданию банка гибридом-продуцентов моноклональных антител к антигенам главного комплекса гистосовместимости человека", 2015-2017 гг.
10. Грант РФФИ 14-04-00997а. «Белок ОРТ6 вируса табачной мозаики –потенциальный белок вирусной безопасности: тканеспецифичность экспрессии и динамическая субклеточная локализация».
11. Грант РФФИ 13-04-00094а, (2015 г.). «Вирусные фабрики: взаимодействие репликативных белков клостеровируса желтухи свеклы (ВЖС) с органеллами клетки, трансформация мембран , формирование и передвижение глобулярных сайтов репликации».
12. Грант РФФИ 15-29-02527 (офи-м). «Изучение разнообразия токсигенных грибов рода Fusarium на территории России молекулярно-генетическими методами и поиск новых высокополиморфных маркеров для их специфической диагностики и идентификации».
Доклады и лекции.
- «Изучение роли нового класса белков растений в межклеточном транспорте макромолекул через плазмодесмы»; Ерохина Т. Н., 2005
- «Studies on plant cell protein At 4/1 capable of interacting with viral movement proteins»; Erokhina T., Minina E., Schepetilnikov M., Solovyev A., Kellmann J., Morozov S.Y., 2005
- «At 4/1-подобные белки растений: свойства и возможная роль во внутри- и межклеточном транспорте макромолекул»; Ерохина Т. Н., 2007
- «Клонирование гена, мутагенез и субклеточная локализация нового белка табака Nt-4/1»; Ерохина Т. Н., Минина Е. А., Гарушянц С. К., Соловьев А. Г., Морозов С. Ю., 2008
- «Эффективный и экономичный метод чувствительной диагностики и идентификации патогенов картофеля»; Завриев С. К., Рязанцев Д. Ю., Кошкина Т. Е., Абрамов Д. Д., 2007
- «ДНК-технологии для диагностики и идентификации токсигенных патогенов зерна и продуктов его переработки»; Завриев С. К., Рязанцев Д. Ю., Абрамова С. Л., Евстратова С. В., Гагкаева Т. Ю., 2008
- «Новые белки из Arabidopsis thaliana: структура и свойства»; Рязанцев Д. Ю., Минина Е. А., 2008
- «Детекция ряда карантинных фитопатогенов методом ПЦР в формате FLASH»; Рязанцев Д. Ю., Абрамов Д. Д, Завриев С. К., 2008
ФИО | Должность | Контакты |
---|---|---|
Завриев Сергей Кириакович, Чл.-корр. РАН, проф., д.б.н. | зав. лаб. | szavriev@ibch.ru |
Ерохина Татьяна Николаевна, к.х.н. | с.н.с. | |
Морозов С.Ю. | с.н.с. | |
Рязанцев Дмитрий Юрьевич, к.б.н. | с.н.с. | |
Комалева Р.Л. | инженер | |
Лахтина О.Е. | инженер | |
Петрова Елена Эдуардовна, к.б.н. | н.с. | |
Симонова Мария Александровна, к.х.н. | н.с. | |
Стахеев Александр Александрович, к.б.н. | н.с. | |
Габриелян Н.Г. | м.н.с. | |
Самохвалова Лариса Вадимовна | м.н.с. | |
Кутуков Руслан Рафигович | инженер | |
Ранее здесь работали | ||
Валякина Т.И., к.б.н. | ||
Черничко Т.Е. | ||
Горюнова Марина Сергеевна | ||
Чигарёва М.С. | ||
Смешнова Д.С. | ||
Звездина Ю.К. | ||
Ковалец П.В. | ||
Меркулова М.П. | ||
Будковская В.Н., к.ф.-м.н. | ||
Дробязина П.Е. |