После окончания МГУ (каф. молекулярной биологии, зав. академик А.С. Спирин)  Лебеденко Е.Н. работает в ИБХ РАН :
1977-1985 гг. в лаборатории химии генов (заведующий лабораторией академик М.Н. Колосов);
1985-2000 гг. в группе генетической инженерии интерлейкинов и лаборатории механизмов генной экспрессии (заведующий профессор Ю.А. Берлин); 2000 г. - по наст. время  старший научный сотрудник лаборатории молекулярной иммунологии (руководитель член-корр. С.М. Деев).
Лауреат Главной премии МАИК «Наука» за лучшую публикацию в издаваемых ею журналах по группе биологических наук за 1998 г. Совместно с Г.В. Шпаковским.
                        
                                    Образование
            
                
                    
                        | Период обучения | 
                        Страна, город | 
                        Учебное заведение | 
                        Дополнительная информация | 
                    
                
                
                                        
                        | 1970–1976 | 
                        Россия, Москва | 
                        МГУ им. М.В. Ломоносова, биофак, каф. мол. биологии | 
                         | 
                    
                                        
                        | 1961–1969 | 
                        Россия, Москва | 
                        Французская спецшкола № 10 | 
                         | 
                    
                                        
                        | 1959–1961 | 
                        Россия, Москва | 
                        Средняя школа №657 | 
                         | 
                    
                                    
            
                        
                        
                                    
                        
                                                Работа в ИБХ
            
                        
                                    
                                                            Степени и звания
            
                
                
                
                                                            
                         | 
                        Кандидат наук                                                         (Биологические науки, 03.00.03 —  Молекулярная биология)                                                     | 
                    
                                                                                
                        | 
                                                     | 
                    
                                    
            
                        
                                    
                        
                                                            Научные интересы
                конструирование неприродных антител, противораковые антитела, мультифункциональные молекулярные конструкции наноразмеров
                
                                                Научные результаты
                1980-1995. Химико-ферментативный синтез гена валиновой тРНК и серии генов биологически активных пептидов; химико-ферментативный синтез и экспрессия генов интерлейкина-1альфа и его аналогов; разработка метода сплайсинга ДНК путем направленного лигирования; выяснение участка узнавания рестриктазы CfrI; выяснение молекулярной природы мутаций в гене бета-глобина человека, приводящих к бета-талассемии.
1995-2000. Клонирование, секвенирование и бактериальная экспрессия целого ряда новых кДНК и генов, кодирующих субъединицы ядерных РНК-полимераз делящихся дрожжей и человека. Сравнительный геномный анализ клонированных генов.
2000 по настоящее время. Конструирование и бактериальная экспрессия генов противораковых мини-антител и их производных.