Отдел «Учебно-научный центр»

Научно-исследовательские подразделения

Руководитель: Овчинникова Татьяна Владимировна, д. х. н., профессор
ovch@ibch.ru+7(495)336-44-44, +7(495)995-55-57#2062

учебный центр, антимикробные пептиды, пептаиболы, антибиотики

Одним из приоритетых направлений деятельности ИБХ РАН является подготовка высококлассных молодых специалистов для физико-химической биологии и биотехнологии. С этой целью в 1982 году академиком Ю.А. Овчинниковым в Институте был организован специализированный Учебный центр, который стал первым учебно-научным центром в нашей стране, объединившем в себе усилия академического института и ряда высших учебных заведений Российской Федерации в деле воспитания молодого поколения исследователей в областибиоорганической химии, физико-химической биологии и биотехнологии. Подробно с образовательной деятельностью УНЦ ИБХ РАН можно ознакомиться на сайте ИБХ РАН в разделе "Обучение". Помимо огромной учебной работы  Отдел ведёт большую научно-исследовательскую работу по изучению функций и свойств нового класса антибиотиков на основе природных антимикробных пептидов.

Тема НИР:«Конструирование лекарственных средств нового поколения на основе природных пептидных антибиотиков — молекулярных факторов врожденного иммунитета»
Руководитель темы: зав. отделом «Учебно-научный центр» Т. В. Овчинникова

В настоящее время медицина столкнулась с проблемой устойчивости патогенов к используемым в клинике антибиотикам, которые уже не всегда обеспечивают контроль над возбудителями инфекционных заболеваний. Стремительный рост резистентных бактериальных инфекций диктует необходимость поиска принципиально новых лекарств. Исследования Учебно-научного центра ИБХ РАН нацелены на комплексное структурно-фукциональное изучение новых природных пептидных антибиотиков, исследование механизмов их действия как молекулярных факторов врожденного иммунитета, разработку технологий получения их рекомбинантных и синтетических аналогов, предклинические испытания и создание на их основе антибиотиков нового поколения.

Выявление многообразных биологических функций эндогенных антимикробных пептидов (АМП) показывает, что эти природные антибиотики обладают способностью инактивировать широкий спектр микроорганизмов, в том числе бактерии, грибы, простейшие, оболочечные вирусы, и являются перспективными молекулами для создания новых антибиотических средств. АМП как молекулярные факторы системы врожденного иммунитета служат медиаторами фагоцитарных, воспалительных и стрессорных процессов. Учитывая наличие антибиотической и иммуномодулирующей активностей у природных АМП, многие зарубежные фармацевтические компании (в США, Канаде, Франции, Нидерландах и др.) приступили к созданию нового класса антибиотиков на их основе. Успешные клинические испытания прошли пептидные антибиотики для лечения сепсиса, менингита, пневмонии, язвенной болезни желудка, диабетической стопы, кандидоза, мукозита, гингивита, акне, импетиго, а также для заживления ожогов и ран, осложненных вторичной инфекцией.

Исследования Учебно-научного центра ИБХ РАН направлены на поиск, выделение, изучение структуры, биологических свойств и молекулярных механизмов действия природных пептидных антибиотиков, разработку биотехнологических способов их получения и проведение предклинических испытаний. Объектами исследований являются АМП бактериального, грибкового, растительного и животного происхождения, в том числе из бактерий Bаcillus licheniformis, грибов Emericellopsis salmocynnemata и Emericellopsis minima, чечевицы Lens culinaris, морского червя Arenicola marina, медузы Aurelia aurita, осетра Acipencer guldenstadti, черепахи Emys orbicularis, жабы Bufo bufo gargarisans и др. В частности, из целомоцитов морского кольчатого червя Arenicola marina были выделены новые пептиды, обладающие ярко выраженной антимикробной активностью в отношении грамположительных и грамотрицательных бактерий, а также дрожжевых грибков и названные ареницинами. Определенная нами полная первичная структура зрелых ареницинов и генов их предшественников позволяет сделать вывод о выявлении нами пептидов нового семейства, не принадлежащих ни к одной из известных ранее групп АМП. Создана эффективная технология гетерологичной экспрессии, получены штаммы-продуценты, разработаны методики выделения и очистки генно-инженерных ареницинов. На оригинальную структуру ареницинов и биотехнологический способ их получения получены патенты РФ. Параллельно продолжаются фундаментальные исследования механизма действия ареницинов, проводятся детальное исследование их биологической активности и предклинические испытания на животных моделях. Продолжаются поиск и структурно-функциональные исследования других природных пептидных антибиотиков. Исследуемые вещества являются оригинальными и патентоспособными. Конечной целью проекта является создание линейки прототипов новых эффективных лекарственных средств на основе природных пептидных антибиотиков и биотехнологической платформы для их получения.

Ф.И.О.ДолжностьКонтакты
Овчинникова Татьяна Владимировна, д. х. н., профессоррук. подр.ovch@ibch.ru+7(495)336-44-44, +7(495)995-55-57#2062
Финкина Екатерина Ивановна, к. х. н.с.н.с.finkina@mail.ru+7(495)335-42-00
Стукачёва Елена Анатольевна, к. б. н.с.н.с.east@ibch.ru+7(495)336-46-00
Сычёв Сергей Владимирович, к. х. н.с.н.с.svs@ibch.ru+7(495)335-66-22
Тагаев Андрей Азисовичс.н.с.andtag@ibch.ru+7(495)335-42-00
Шамборант Ольга Георгиевнас.н.с.osha@ibch.ru+7(495)336-46-00
Богданов Иван Владимирович, к. х. н.н.с.contraton@mail.ru+7(495)335-42-00
Гурьянова Светлана Владимировна, к. б. н.н.с.svgur@mail.ru
Пантелеев Павел Валерьевич, к. х. н.н.с.alarm14@gmail.com+7(495)335-09-00
Белогурова-Овчинникова Оксана Юрьевна, к. б. н.н.с.ovchox@gmail.com+7(910)4394341
Баландин Сергей Владимирович, к. х. н.н.с.serb@ibch.ru+7(495)335-09-00
Тележинская Ирина Никитична, к. х. н.н.с.teleir@ibch.ru+7(495)335-09-00
Кузьмин Денис Владимирович, к. б. н.н.с.denisk@list.ru
Мельникова Дарья Николаевна, к. х. н.н.с.d_n_m_@mail.ru+7(495)3354200
Болосов Илья Александровичм.н.с.bolosoff@gmail.com+7(495)3354200
Фурс Ольга Владимировнам.н.с.sokroventa@mail.ru
Калашников Александр Александровичасп.kalashnikov.aa@phystech.edu+7(925)8212827
Емельянова Анна Андреевнаасп.annaemelyan@gmail.com
Маргграф (Калашникова) Марьяна Борисовнаасп.thpcb92@mail.ru
Кузницова Светлана Владимировнаинженерksibch@list.ru+7(495)336-67-22
Чичерина Галина Александровнаинженер+7(495)336-46-00
Алёшина Екатерина Федоровнаинженер
Бойко Галина Алексеевназав. аспир.asping@ibch.ru+7(495)330-24-00
Леонова Юлия Федоровнаст. инж.leonovajuf@yandex.ru+7(495)335-09-00
Свищёва Наталия Витальевнаст. инж.natasvi@mail.ru+7(495)335-42-00, +7(495)741-78-20
Снежкова Леона Генриховна, к. х. н.ст. инж.+7(495)335-66-22
Суханов Станислав Владимировичст. инж.ssv@ibch.ru+7(495)335-66-22
Симонова Татьяна Николаевнаст. инж.tsimonova@ibch.ru+7(495)335-66-22
Шереметьева Эльвира Владимировнаст. инж.kioschi@bk.ru+7(495)335-66-22
Есипов Дмитрий Станиславовичст. инж.
Романова Татьяна Витальевнаст. инж.

Избранные публикации (показать все)

Загружаются...

Овчинникова Татьяна Владимировна

  • Москва, ул. Миклухо-Маклая, 16/10 — На карте
  • ИБХ РАН, корп. 32, комн. 610
  • Тел.: +7(495)336-44-44
  • Эл. почта: ovch@ibch.ru
  • Факс: +7 (495) 336-43-33

Димеризация β-шпилечных антимикробных пептидов играет ключевую роль в проявлении цитотоксичности, но не антимикробной активности (2017-12-03)

Антимикробные пептиды ареницины были обнаружены нами ранее в целомоцитах морского кольчатого червя пескожила Arenicola marina. В 2017 г. исследована взаимосвязь структуры аналогов β-шпилечного антимикробного пептида ареницина-1 и их  биологической активности с целью поиска подходов, позволяющих снизить цитотоксичность природного пептида и создать терапевтически ценные препараты. Для этого с использованием методов сайт-направленного мутагенеза и гетерологической экспрессии в бактериальной системе был создан широкий спектр аналогов ареницина-1 (более 50 пептидов), различающихся по гидрофобности, суммарному заряду, длине цепи. Полученные данные указывают на то, что переход пептида в форму димера, а не его высокая гидрофобность является ключевым фактором, обуславливающим проявление цитотоксических свойств природным пептидом. Выраженная бактерицидная активность в отношении патогенных бактерий, в том числе, мультирезистентных штаммов, а также высокий терапевтический индекс позволяют рассматривать сконструированные аналоги ареницина в качестве перспективных прототипов антибиотиков нового поколения с широким спектром действия.

Раскрыт механизм связывания и переноса липидов растительными липид-транспортирующими белками (2017-12-03)

Новые липид-транспортирующие белки (LTP) чечевицы, гороха и укропа были выделены и охарактеризованы в Учебно-научном центре ранее. В 2017 г. нами показана способность растительных LTP с различной эффективностью связывать и переносить широкий спектр липидных молекул. Установлено, что аффинность LTP по отношению к насыщенным и ненасыщенным жирным кислотам возрастает по мере уменьшения длины ацильных цепей.  Показано, что LTP эффективнее переносят анионный липид DMPG, чем цвиттерионный DMPC. Методами ЯМР-спектроскопии подтверждена более высокая аффинность LTP к анионным липидам и молекулам с небольшим размером гидрофобных цепей. Определена пространственная структура комплекса Lc-LTP2/LPPG. Установлено, что размер внутренней гидрофобной полости LTP увеличивается от 600 до 1000 А3 при связывании с липидами. Ацильные цепи LPPG или DMPG занимают пространство гидрофобной полости LTP, а головки липидов выступают наружу между α–спиральными участками Н1 и Н3. Другой вход в гидрофобную полость Lc-LTP2, ограниченный петлей между α–спиралями H2-H3 и С-концевым участком, играет важную роль во взаимодействии с поверхностью мембраны, участвует в поглощении липидов и определяет селективность LTP по отношению к лиганду. Полученные результаты впервые раскрывают механизм связывания и переноса липидов посредством LTP и углубляют понимание биологической роли растительных LTP.