Списки аспирантов и портфолио

112

Спеченкова Надежда Андреевна

Дата начала обучения 2017-10-02
Дата окончания обучения 2021-10-01
Руководитель Тальянский Михаил Эммануилович
Специальность Биотехнология (в том числе бионанотехнологии) [03.01.06]
Статус Обучается

Отчеты аспиранта

0 год обучения (2017)

ОБОСНОВАНИЕ  ТЕМЫ  ДИССЕРТАЦИОННОЙ  РАБОТЫ

 

В последнее время появился широкий спектр научной информации, свидетельствующей о существенной роли клеточного ядра и субъядерных структур в защите эукариотических организмов, и в том числе растений, от экологических стрессов и болезней. В частности, был идентифицирован ряд белков ядрышка и телец Кахаля, контролирующиx устойчивость растений к вирусам и абиотическим стрессам.

Целью данной диссертационной работы является глобальный протеомный анализ белков ядра растений картофеля до и после воздействия комбинированного биотического и абиотического стресса. В качестве биотического стресса предполагается инфицирование растений картофеля вирусом У картофеля (PVY) и бактерией Clavibacter michiganensis subsp. Sepedonicus (Cms) на фоне повышенных температур в качестве абиотического (экологического) стресса. Предварительная работа, проведённая в ФИБХ РАН, позволила отобрать сорта картофеля, контрастные по физиологической реакции на данный комплексный стресс, которые и будут использованы в качестве основных объектов исследования.

Предполагается провести сравнительный анализ протеомов ядра контрастных сортов до и после воздействия комбинированным стрессом. В результате работы будут идентифицированы стресс-зависимые (up- и down-регулируемые) ядерные белки, а также белки посттрансляционно-модифицируемые или ре-локализуемые  под воздействием стресса. Дальнейший биоинформатический анализ позволит выявить наиболее подходящие белки-мишени, контролирующие устойчивость растений к комплексному стрессу. Экспериментальное доказательство функций данных генов будет получено при их пониженной (knock-down RNAi или knock-out геномное редактирование) или гипер-экспрессии в трансгенных растениях. В результате работы будет получена коллекция генов картофеля для дальнейшего использования в селекционных программах.

1 год обучения (2018)

Проведена оптимизация метода выделения ядерных белков для проведения протеомного анализа. 

Завершён суммарный протеомный анализ здоровых растений контрастных сортов картофеля Гала и Чикаго и растений, заражённых У-вирусом картофеля при нормальной и повышенной температуре.

Осуществляется подбор литературы по изучению протеома картофеля в норме и в условиях различных стрессов.