В последнее время технологии, основанные на методах массированного секвенирования, все чаще используются для анализа патологий различного происхождения. Эти методы отличаются высокой чувствительностью и воспроизводимостью. В ходе работы по проекту РНФ за 2016-2018 годы нами разработан новый комплексный подход к оценке статуса адаптивного иммунитета, который включает в себя стандартизованный протокол пробоподготовки для массированного секвенирования, анализ данных и протокол иммунофенотипирования. Наше исследование показало, что возрастной иммунодефицит выражается не только в сужении репертуара ТКР и падении доли наивных Т лимфоцитов в общем пуле Т клеток, но также проявляется в изменениях физико-химических свойств и структуры репертуара пулов наивных CD4 и CD8 лимфоцитов. В рамках продолжения данного проекта планируется получить данные по оценке статуса адаптивного иммунитета с использованием тест-системы при разных патологических состояниях. Первая задача является продолжением нашего исследования по изучению первичного В-клеточного иммунодефицита. Здесь нам впервые удалось показать, как отсутствие В-клеток влияет на формирование репертуара ТКР. На ближайшие два года запланировано получение и анализ репертуаров ТКР функциональных субпопуляций наивных CD4 лимфоцитов, для сравнения изменений физико-химических свойств ТКР в норме и при иммунодефиците. Такие исследования помимо решения фундаментальных вопросов, могут иметь и прикладной характер. Например, полученные нами данные свидетельствуют о высоком содержании высоко-аффинных ТКР у пациентов с иммунодефицитом, которые могут быть ассоциированы с развитием аутоиммунных заболеваний. Информация такого рода может быть использована в лечебной практике. С помощью разработанного нами комплексного подхода к оценке статуса адаптивного иммунитета мы планируем изучить, восстановление собственного репертуара ТКР в посттрансплантационный период при злокачественных гематологических заболеваниях у детей. Известно, что применение различных режимов кондиционирования может оказывать воздействие на продуктивную активность тимуса, но детальное исследование репертуара ТКР недавних тимусных эмигрантов, а также регуляторных Т клеток не проводилось. Наше исследование расширит представления об отдаленных последствиях различных протоколов кондиционирования на работу адаптивного иммунитета. Еще одна задача, на решение которой направлен предлагаемый проект, связана с оценкой долговременного влияния противовирусной терапии на репертуар CD4 и CD8 Т лимфоцитов в периферической крови человека. Показано, что CMV-позитивный статус коррелирует с ускоренным снижением числа и процента наивных CD4 T лимфоцитов и меньшей продолжительностью жизни. Наше исследование позволит определить происходит ли изменения структуры репертуара CD4 и CD8 лимфоцитов, что может указывать на опосредованное позитивное влияние противовирусных препаратов на адаптивный иммунитет.