Лаборатория структуры и функций генов человека

Отдел геномики и постгеномных технологий

Руководитель: Свердлов Евгений Давидович, академик
+7 (495) 330-65-29 · sverd@ibch.ru

humgen.siobc.ras.ru

Функциональная геномика бактерий и человека, молекулярные механизмы канцерогенеза, взаимодействие патоген-хозяин, диагностика и генная терапия онкологических заболеваний

Основные достижения

Геномика цис-регуляторных элементов (Л. Г. Николаев, С. Б. Акопов, И. П. Чернов, Т. Л. Ажикина)

После определение нуклеотидных последовательностей ряда эукариотических геномов главной задачей становится изучение регуляторных механизмов, определяющих фенотипическое разнообразие организмов. В геноме млекопитающих имеется до 30000 генов, кодирующих белки; при этом транскрибируется значительно большая часть генома. Вся совокупность генов и транскрибируемых областей генома многоклеточных организмов связана в сложнейшую регулируемую сеть, определяющую существование многочисленных типов специализированных клеток. Транскрипция генов и некодирующих последовательностей регулируется на нескольких уровнях: линейной архитектуры генома, представленной цис-регуляторными элементами ДНК, модификации ДНК, структуры хроматина, компартментной организации ядра и др.

Несмотря на достижения в изучении организации отдельных регуляторных систем, мы все еще далеки от полного понимания механизмов, управляющих геномом как целым. Даже в относительно простых случаях идентификации цис-регуляторов, мы встречаем серьезные затруднения, требующие для их преодоления длительных усилий большого числа исследователей. В качестве примера можно указать, что согласно теоретическим предсказаниям геном человека может содержать до 100000 энхансеров и сайленсеров, однако к настоящему времени охарактеризована лишь небольшая их часть.

Важнейшей составной частью регуляторной машины генома являются эпигенетические элементы, то есть элементы, определяющие стабильно наследуемые изменения в уровне экспрессии генов без изменения последовательности ДНК. К ним относятся участки метилирования ДНК, области, содержащие различным образом модифицированные гистоны и др. Метилирование CpG сайтов геномной ДНК у млекопитающих играет ключевую роль в регуляции экспрессии генов через модификацию последовательностей цис-регуляторных элементов или же модификацию протяженных геномных участков, ассоциированных с изменением конформации хроматина. Для объяснения механизмов метил-зависимой регуляции генной экспрессии необходимы подробные карты метилирования протяженных геномных локусов, сравнение которых в разных типах клеток может выявить закономерности влияния метилирования на экспрессию.

В лаборатории разработаны методы идентификации и геномного картирования неметилированных CpG динуклеотидов, точек начала транскрипции, ряда регуляторных элементов генома — участков прикрепления ДНК к ядерному матриксу (S/MARs), инсуляторов, энхансеров, участков открытого и закрытого хроматина, а также участков связывания регуляторных ядерных белков, включая факторы транскрипции в протяженных (1–2 млн. п. о.) участках ДНК. Полученная информация интегрируется на относительно небольшом (1 млн. п. о.) участке хромосомы 19 человека. Проводится работа по созданию физических карт полигенных областей генома человека в нормальных и опухолевых тканях, направленная на решение широкого круга проблем, связанных с регуляцией генома, а также для практического применения в медико-генетических целях.

Интегрированная карта положений регуляторных элементов для участка хромосомы 19 человека длиной 500 тыс. пар оснований. Вертикальные цветные линии указывают положения соответствующих управляющих элементов.

Структурно-функциональное исследование бактериального патогенеза Mycobacterium tuberculosis, Burkholderia pseudomallei и Burkholderia mallei (Т. Л. Ажикина, Г. С. Монастырская)

Туберкулёз — хроническое инфекционное заболевание, вызываемое грамположительной бактерией Mycobacterium tuberculosis — остается одной из 10 основных причин преждевременной смерти в мире и второй среди инфекций. Геном микобактерии чрезвычайно изменчив, что затрудняет диагностику и лечение туберкулеза. Нами разработана экспериментальная методика сравнительного анализа геномов — ПДРФ вычитающая гибридизация, позволяющая сравнивать геномы близкородственных бактериальных штаммов. С ее помощью впервые проведено сравнение геномов различных штаммов M. tuberculosis, циркулирующих на территории РФ и вызывающих различные клинические формы заболевания. На основе полученных последовательностей разработан экспериментальный подход для изучения инсерционно-делеционного полиморфизма российской популяции M. tuberculosis (ID-типирование).

M. tuberculosis вызывает у людей инфекцию с широким спектром клинических проявлений, который зависит от сложных и все еще мало изученных взаимодействий между паразитом и хозяином. Мы исследуем полный спектр транскрипции генов M. tuberculosis при первичной инфекции, при переходе в хроническую и латентную формы, что поможет выявить механизмы, с помощью которых возбудитель избегает эффективного ответа хозяина. В сотрудничестве с лабораторией иммуногенетики ЦНИИ туберкулеза РАМН (д. б. н., проф. А. С. Апт) мы разработали метод анализа транскриптома внутриклеточных патогенов непосредственно в инфицированных тканях, который может быть использован для исследований любого возбудителя, в том числе для поиска факторов вирулентности, мишеней лекарственной терапии, разработки стратегии эпидемиологического мониторинга заболевания.

Совместно с ГНЦ прикладной микробиологии и биотехнологии (И. Абаев) проведено полногеномное сравнение штаммов патогенов Burkholderia pseudomallei C—141 и Burkholderia mallei C5, вызывающих мелиоидоз и сап. Получена библиотека фрагментов ДНК, различающихся у B. pseudomallei C141 и B. mallei C5. Дифференциальные фрагменты могут быть использованы для диагностики сапа и мелиоидоза.

Положение найденных дифференциальных фрагментов (кружки) на карте делеций в геномах штаммов M. tuberculosis, отражающей неслучайный характер распределения делетированных участков. Цифры показывают расстояние в геноме (в млн. п. о.), 0 — точка начала репликации.

Разработка подходов к диагностике и генной терапии онкологических заболеваний (Т. В. Виноградова, Е. П. Копанцев, И. П. Чернов)

Большое внимание в последние годы уделяется проблемам создания лекарств нового поколения. В рамках федеральной целевой программы «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2007–2012 годы» с участием лаборатории осуществляется крупный комплексный проект «Разработка и выпуск опытных партий новых эффективных направленно-модифицированных терапевтических и диагностических средств постгеномной генерации для использования в онкологической практике». Целью этого проекта является создание и выпуск в клинику первых генно-терапевтических препаратов для лечения рака легкого и пищевода. Используемые в проекте подходы базируются на фундаментальных исследованиях и методических разработках, выполненных в лаборатории. Проект объединяет крупнейшие научные центры страны: Институт молекулярной генетики РАН, Российский онкологический научный центр им. Н. Н. Блохина РАМН, Институт биоорганической химии им. академиков М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова, Новосибирский государственный университет, Институт биологии гена РАН, Институт эпидемиологии и микробиологии им. Н. Ф. Гамалеи РАМН, а также биотехнологические компании ЗАО «Евроген» и ЗАО «Биннофарм». В рамках проекта созданы конструкции, позволяющие осуществлять специфическую экспрессию терапевтических генов в раковых клетках, а также системы доставки терапевтических генов в опухоли.

Таким образом, была создана основа для разработки и производства новых эффективных медицинских препаратов для онкологии: терапевтических средств на основе генно-терапевтического подхода, терапевтических средств на основе биологически активных белков и диагностических препаратов.

Рак и развитие (М. В. Зиновьева, Т. В. Виноградова, Г. С. Монастырская)

Одним из важнейших результатов, полученных в рамках этого проекта, является демонстрация того, что гены, которые включаются в эмбриогенезе при развитии легких и пищевода, выключаются при превращении нормальных клеток в раковые и наоборот. Тем самым подтверждается гипотеза о том, что возникновение и развитие раковых клеток можно сравнить с эмбриональным развитием или самовоспроизводством и дифференцировкой стволовых клеток тех или иных тканей. Гены, имеющие дифференциальную экспрессию и при раке и при развитии, возможно, являются ключевыми для опухолеобразования. Исследование таких генов позволяет осуществлять рациональный выбор мишеней терапевтического воздействия: наиболее перспективными мишенями являются системы, регулирующие эмбриональное развитие и нарушенные при канцерогенезе.

Модифицированные олигонуклеотиды (В. К. Потапов)

Главным направлением работы группы в последние 3 года было разработка методов получения и синтез модифицированных нуклеозидов с измененной структурой основания или сахаро-фосфатного остова. Наиболее перспективным направлением является разработка подходов к твердофазному синтезу морфолино-олигонуклеотидов — аналогов, несущих в своем составе вместо рибозы остаток морфолина. Аналоги сохраняют структуру ДНК, образуют прочные комплементарные комплесы с природными олигонуклеотидами и являются незаряженными молекулами, устойчивыми к действию нуклеаз.

Второе направление — синтез олигонуклеотидов, несущих в определенных местах спейсеры заданной длины с тиольной группой, которые используются группой проф. Влодовера из NCI (Frederic) для изучения комплексов с интегразами HIV—1 и ASV методами рентгеноструктурного анализа.

Ф.И.О.ДолжностьЭл. почта
Аверина Людмила Викторовнаинженер
Ажикина Татьяна Леодоровна, д. б. н.с.н.с.
Акопов Сергей Борисович, к. б. н.с.н.с.
Беляева Нина Николаевна, к. б. н.н.с.
Билтуева Юлия асп.
Бони Ирина Венедиктовна, к. х. н.с.н.с.
Буланенкова Светлана Сергеевна, к. б. н.н.с.
Виноградова Татьяна Викторовна, к. б. н.с.н.с.
Дидыч Дмитрий Александрович, к. б. н.н.с.
Завалова Людмила Львовна, к. б. н.с.н.с.
Зиновьева Марина Валерьевна, к. б. н.н.с.
Кашкин Кирилл Никитич, к. б. н.н.с.
Колединская Людмила Сергеевнам.н.с.
Копанцев Евгений Павлович, к. б. н.с.н.с.
Кравченко Зоя Борисовнаинж.-иссл.
Левитан Татьяна Львовнаинж.-иссл.
Медведева Наталия Игоревнаинж.-иссл.
Монастырская Галина Сергеевна, к. х. н., старший научный сотрудникв.н.с.
Николаев Лев Григорьевич, д. б. н.с.н.с.
Овчинникова Оксана Юрьевна, к. б. н.
Погосян Рудольф Андреевичм.н.с.
Потапов Виктор Кузьмич, д. х. н.в.н.с.
Сасс Александр Викторовичм.н.с.
Скапцова Надежда Васильевнан.с.
Снежков Евгений Валерьевич, к. х. н.с.н.с.
Успенская Наталия Яковлевна, к. б. н.с.н.с.
Филюкова Ольга Борисовна, к. б. н.н.с.
Чернов Игорь Павлович, к. х. н.н.с.

Избранные публикации

  1. Kopantzev E.P., Monastyrskaya G.S., Vinogradova T.V., Zinovyeva M.V., Kostina M.B., Filyukova O.B., Tonevitsky A.G., Sukhikh G.T., Sverdlov E.D. (2008). Differences in gene expression levels between early and later stages of human lung development are opposite to those between normal lung tissue and non-small lung cell carcinoma. Lung Cancer 62 (1), 23–34 [+]

    We, for the first time, directly compared gene expression profiles in human non-small cell lung carcinomas (NSCLCs) and in human fetal lung development. Previously reported correlations of gene expression profiles between lung cancer and lung development, deduced from matching data on mouse development and human cancer, have brought important information, but suffered from different timing of mouse and human gene expression during fetal development and fundamental differences in tumorigenesis in mice and humans. We used the suppression subtractive hybridization technique to subtract cDNAs prepared from human fetal lung samples at weeks 10-12 and 22-24 and obtained a cDNA library enriched in the transcripts more abundant at the later stage. cDNAs sequencing and RT-PCR analysis of RNAs from human fetal and adult lungs revealed 12 differentially transcribed genes: ADH1B, AQP1, FOLR1, SLC34A2, CAV1, INMT, TXNIP, TPM4, ICAM-1, HLA-DRA, EFNA1 and HLA-E. Most of these genes were found up-regulated in mice and rats at later stages than in human lung development. In surgical samples of NSCLC, these genes were down-regulated as compared to surrounding normal tissues and normal lungs, thus demonstrating opposite expression profiles for the genes up-regulated during fetal lung development.

  2. Chernov I.P., Timchenko K.A., Akopov S.B., Nikolaev L.G., Sverdlov E.D. (2007). Identification of tissue-specific DNA-protein binding sites by means of two-dimensional electrophoretic mobility shift assay display. Anal. Biochem. 364 (1), 60–6 [+]

    We developed a technique of differential electrophoretic mobility shift assay (EMSA) display allowing identification of tissue-specific protein-binding sites within long genomic sequences. Using this approach, we identified 10 cell type-specific protein-binding sites (protein target sites [PTSs]) within a 137-kb human chromosome 19 region. In general, tissue-specific binding of proteins from different nuclear extracts by individual PTSs did not follow the all-or-nothing principle. Most often, PTS-protein complexes were formed in all cases, but they were different for different nuclear extracts used.

  3. Bulanenkova S., Snezhkov E., Nikolaev L., Sverdlov E. (2007). Identification and mapping of open chromatin regions within a 140 kb polygenic locus of human chromosome 19 using E. coli Dam methylase. Genetica 130 (1), 83–92 [+]

    Using transient expression of the E. coli Dam methylase gene and analysis of the distribution of methylated GATC sites, we studied the distribution of open chromatin regions within a 140 kb long human genome segment in HEK-293 cells. Dam methylated sites were found in gene introns, exons, and intergenic regions, and their distribution along DNA was uneven. There were regions of high and low density of Dam methylated GATC sites, presumably corresponding to "open" and "closed" chromatin regions, respectively, and to the functional profile of the genomic locus under study. The Dam methylation profile was also generally in agreement with transcriptional activity of genes in the locus. Moreover, DNA regions accessible to Dam methylase apparently coincided with those hypersensitive to DNase I.

  4. Illarionova A.E., Vinogradova T.V., Sverdlov E.D. (2007). Only those genes of the KIAA1245 gene subfamily that contain HERV(K) LTRs in their introns are transcriptionally active. Virology 358 (1), 39–47 [+]

    Insertion of LTRs into some genome locations might seriously affect regulation of the neighboring genes expression. This hypothesis is widely accepted but, however, not confirmed directly. Earlier, we have identified a family of closely related genes highly similar to the KIAA1245 mRNA counterpart. This family included a subfamily of genes some of which contained and the others lacked an LTR in their structure. We compared transcription of several closely related genes of the subfamily differing in the presence or absence of LTRs. Only LTR-containing genes were transcribed in transformed cell lines, tumorous and embryonic human tissues, whereas LTR-lacking genes remained silent. Since the genes were in the same intracellular microenvironment, we suggested that this effect was most probably due to intrinsic cis-characteristics of integrated LTRs and confirmed this by demonstrating high enhancer activity of KIAA1245 LTRs. The expression of the LTR-containing genes in embryonic tissues might suggest their involvement in evolutionary events during primate speciation.

  5. Buzdin A., Kovalskaya-Alexandrova E., Gogvadze E., Sverdlov E. (2006). At least 50% of human-specific HERV-K (HML-2) long terminal repeats serve in vivo as active promoters for host nonrepetitive DNA transcription. J. Virol. 80 (21), 10752–62 [+]

    В статье приведены результаты полногеномного исследования, выявившего, что более 50% всех специфичных для ДНК человека вставок эндогенных ретровирусов активны как промоторы для соседних уникальных участков генома

  6. Akopov S.B., Ruda V.M., Batrak V.V., Vetchinova A.S., Chernov I.P., Nikolaev L.G., Bode J., Sverdlov E.D. (2006). Identification, genome mapping, and CTCF binding of potential insulators within the FXYD5-COX7A1 locus of human chromosome 19q13.12. Mamm. Genome 17 (10), 1042–9 [+]

    Identification of insulators is one of the most difficult problems in functional mapping of genomes. For this reason, up to now only a few insulators have been described. In this article we suggest an approach that allows direct isolation of insulators by a simple positive-negative selection based on blocking enhancer effects by insulators. The approach allows selection of fragments capable of blocking enhancers from mixtures of genomic fragments prepared from up to 1-Mb genomic regions. Using this approach, a 1-Mb human genome locus was analyzed and eight potential insulators were selected. Five of the eight sequences were positioned in intergenic regions and two were within introns. The genes of the alpha-polypeptide H+/K+ exchanging ATPase (ATP4A) and amyloid beta (A4) precursor-like protein 1 (APLP1) within the locus studied were found to be flanked by insulators on both sides. Both genes are characterized by distinct tissue-specific expression that differs from the tissue specificity of the surrounding genes. The data obtained are consistent with the conception that insulators subdivide genomic DNA into loop domains that comprise genes characterized by similar expression profiles. Using chromatin immunoprecipitation assay, we demonstrated also that at least six of the putative insulators revealed in this work could bind the CTCF transcription factor in vivo. We believe that the proposed approach could be a useful instrument for functional analysis of genomes.

  7. Fushan A., Monastyrskaya G., Abaev I., Sverdlov E. (2006). Genomic fingerprinting of Burkholderia pseudomallei and B. mallei pathogens with DNA array based on interspecies sequence differences obtained by subtractive hybridization. Res. Microbiol. 157 (7), 684–92 [+]

    The ability to rapidly and efficiently identify causative agents of dangerous human and animal diseases is a prerequisite to diagnosis, prophylaxis and therapy. Such identification systems can be developed based on DNA markers enabling differentiation between various bacterial strains. One source of these markers is genetic polymorphism. An efficient method for detecting the most stable polymorphisms without knowledge of genomic sequences is subtractive hybridization. In this work we report an approach to typing of Burkholderia pseudomallei and B. mallei that cause melioidosis and glanders, respectively. Typing is based on hybridization of bacterial genomes with a DNA array of genomic markers obtained using subtractive hybridization. The array comprised 55 DNA fragments which distinguished the genomes of B. pseudomallei C-141 and B. mallei C-5 strains, and it was used to test 28 radioactively labeled B. pseudomallei strains and 8 B. mallei strains. Each strain was characterized by a specific hybridization pattern, and the results were analyzed using cluster analysis. 18 patterns specific to B. pseudomallei and 6 patterns specific to B. mallei were found to be unique. The data allowed us to differentiate most studied B. pseudomallei variants from one another and from B. mallei strains. It was concluded that DNA markers obtained by subtractive hybridization can be potentially useful for molecular typing of B. pseudomallei and B. mallei strains, as well as for their molecular diagnosis. The method reported can be easily adapted for use both with DNA arrays and DNA microarrays with fluorescent probes.

  8. Vetchinova A.S., Akopov S.B., Chernov I.P., Nikolaev L.G., Sverdlov E.D. (2006). Two-dimensional electrophoretic mobility shift assay: identification and mapping of transcription factor CTCF target sequences within an FXYD5-COX7A1 region of human chromosome 19. Anal. Biochem. 354 (1), 85–93 [+]

    An approach for fast identification and mapping of transcription factor binding sites within long genomic sequences is proposed. Using this approach, 10 CCCTC-binding factor (CTCF) binding sites were identified within a 1-Mb FXYD5-COX7A1 human chromosome 19 region. In vivo binding of CTCF to these sites was verified by chromatin immunoprecipitation assay. CTCF binding sites were mapped within gene introns and intergenic regions, and some of them contained Alu-like repeated elements.

  9. Azhikina T., Gainetdinov I., Skvortsova Y., Sverdlov E. (2006). Methylation-free site patterns along a 1-Mb locus on Chr19 in cancerous and normal cells are similar. A new fast approach for analyzing unmethylated CCGG sites distribution. Mol. Genet. Genomics 275 (6), 615–22 [+]

    We describe a newly developed technique for rapid identification of positions of genomic DNA breaks, preexisting or introduced by specific digestion, in particular, by restriction endonucleases (RIDGES). We applied RIDGES in analyzing unmethylated CCGG sites distribution along a 1-Mb long genome region (D19S208-COX7A1 on chromosome 19) in cancerous and normal lung tissues. Both tissues were characterized by a profoundly uneven density of unmethylated sites along the fragment. Interestingly, the distribution of hypomethylated regions did not correlate with gene locations within the fragment, and one of the most hypomethylated areas contained practically no genes. We also demonstrated that the methylation pattern of a long genome DNA fragment was rather stable and practically unchanged in human lung cancer tissue as compared with its normal counterpart, in accordance with the suggestion (Ross et al. in Nat Genet 24:227-235, 2000) that cell lines of common origin have typically similar transcription profiles. An analogous suggestion might probably be made for global methylation patterns of genomic DNA.

  10. Azhikina T., Gvozdevsky N., Botvinnik A., Fushan A., Shemyakin I., Stepanshina V., Lipin M., Barry C. 3rd, Sverdlov E. (2006). A genome-wide sequence-independent comparative analysis of insertion-deletion polymorphisms in multiple Mycobacterium tuberculosis strains. Res. Microbiol. 157 (3), 282–90 [+]

    We applied an enhanced version of subtractive hybridization for comparative analyses of indel differences between genomes of several Mycobacterium tuberculosis strains widespread in Russian regions, and the H37Rv reference strain. A number of differences were detected and partially analyzed, thus demonstrating the practicality of the approach. A majority of the insertions found were shared by all Russian strains, except for strain 1540 that revealed the highest virulence in animal tests. This strain possesses a number of genes absent from other clinical strains. Two of the differential genes were found to encode putative membrane proteins and are presumed to affect mycobacterial interaction with the host cell, thus enhancing virulent properties of the isolate. The method used is of general application, and enables the elaboration of a catalogue of indel polymorphic genomic differences between closely related strains.

  11. Kovalskaya E., Buzdin A., Gogvadze E., Vinogradova T., Sverdlov E. (2006). Functional human endogenous retroviral LTR transcription start sites are located between the R and U5 regions. Virology 346 (2), 373–8 [+]

    Human endogenous retroviruses (HERVs) occupy about 5% of human DNA and are thought to be remnants of ancient retroviral infections of human ancestors' germ cells. HERVs can modify expression of host cell genes through their cis-regulatory elements concentrated in their long terminal repeats (LTRs). Although numerous HERV-related RNAs were identified in the human transcriptome, for most of them, it remains unclear whether they are LTR-promoted or read-through products initiated from neighboring genomic promoters. Here, we describe mapping of transcriptional start sites within solitary and proviral LTRs of the HERV-K (HML-2) human-specific subfamily of endogenous retroviruses. Surprisingly, the transcription was initiated predominantly from the very 3' termini of the LTR R regions. The data presented here may shed light on adaptive coevolution of human endogenous retroviruses with their host cells.

  12. Buzdin A., Kovalskaya-Alexandrova E., Gogvadze E., Sverdlov E. (2006). GREM, a technique for genome-wide isolation and quantitative analysis of promoter active repeats. Nucleic Acids Res. 34 (9), e67 [+]

    В статье опубликован новый метод, позволяющий проводить мониторинг транскрипционной активности повторяющихся элементов генома на полногеномном уровне

  13. Mamedov I., Batrak A., Buzdin A., Arzumanyan E., Lebedev Y., Sverdlov E.D. (2002). Genome-wide comparison of differences in the integration sites of interspersed repeats between closely related genomes. Nucleic Acids Res. 30 (14), e71 [+]

    Представлен окончательный вариант экспериментального подхода к полногеномному сравнительному анализу распределения участков интеграции LTR-элементов в геномах близкородственных видов. Впервые идентифицировано и предварительно охарактеризовано 11 инсерций LTR-элементов, отличающих геном человека от генома шимпанзе.

  14. Buzdin A., Khodosevich K., Mamedov I., Vinogradova T., Lebedev Y., Hunsmann G., Sverdlov E. (2002). A technique for genome-wide identification of differences in the interspersed repeats integrations between closely related genomes and its application to detection of human-specific integrations of HERV-K LTRs. Genomics 79 (3), 413–22 [+]

    В статье опубликован новый метод, позволяющий сравнивать распределение геномных повторов между близкородственными геномами при помощи метода вычитающей гибридизации

  15. Sverdlov E.D. (2000). Retroviruses and primate evolution. BioEssays 22 (2), 161–171 [+]

    Human endogenous retroviruses (HERVs), probably representing footprints of ancient germ-cell retroviral infections, occupy about 1% of the human genome. HERVs can influence genome regulation through expression of retroviral genes, either via genomic rearrangements following HERV integrations or through the involvement of HERV LTRs in the regulation of gene expression. Some HERVs emerged in the genome over 30 MYr ago, while others have appeared rather recently, at about the time of hominid and ape lineages divergence. HERVs might have conferred antiviral resistance on early human ancestors, thus helping them to survive. Furthermore, newly integrated HERVs could have changed the pattern of gene expression and therefore played a significant role in the evolution and divergence of Hominoidea superfamily. Comparative analysis of HERVs, HERV LTRs, neighboring genes, and their regulatory interplay in the human and ape genomes will help us to understand the possible impact of HERVs on evolution and genome regulation in the primates.

Руководитель подразделения

Свердлов Евгений Давидович

  • Москва, ул. Миклухо-Маклая, 16/10 — На карте
  • ИБХ РАН, корп. 52, комн. 657
  • Тел.: +7 (495) 330-65-29
  • Эл. почта: sverd@ibch.ru

Cекретарь-референт

Левитан Татьяна Львовна

  • Тел.: +7 (495) 330-65-29
  • Факс: +7 (495) 330-65-38
  • Эл. почта: levitanibh@mail.ru