Модульная платформа Subdate: новый подход для эффективного поиска наиболее реакционноспособных субстратов
Вычислительные методы в биокатализе в основном сосредоточены на инженерии каталитических матриц, тогда как поиск наиболее реакционноспособных субстратов для конкретного катализатора остается значительно менее представленным направлением. Количественно воспроизводя экспериментально наблюдаемый барьер активации, подход на основе ab initio метадинамики и анализа топологии электронной плотности молекулы формирует теоретическую основу для быстрого прогнозирования каталитически активных субстратов в обширных химических библиотеках. Обычная стратегия прямого стохастического анализа библиотек субстратов требует значительных вычислительных и временных ресурсов. Сотрудники ГНЦ ИБХ РАН совместно с коллегами разработали вычислительный протокол Subdate, который реализует стратегию предварительной кластеризации соединений в библиотеке на основе ключевых параметров электронной плотности в критических точках катализируемых связей, что позволяет эффективно исследовать библиотеки соединений и концентрировать вычислительные ресурсы на наиболее перспективных группах молекул. Работа опубликована в журнале Proceedings of the National Academy of Sciences.
Новости 
- Открытый семинар Отдела иммунологии
наука
11.VII В среду, 15 июля, в 15:00, состоится открытый семинар Отдела иммунологии ГНЦ ИБХ РАН! Место проведения - Малый зал на 3-м этаже (БОН). Семинар посвящен предзащитам кандидатских диссертаций аспирантов 4-го года обучения: Алексеевой Надежды Алексеевны, научный руководитель - к.б.н. Коваленко Елена Ивановна и аспиранта МФТИ Алексеевой Ольги Николаевны, научный руководитель – к.б.н. Липатова Анастасия Валерьевна.
- Исследована роль мутаций в трансмембранном домене инсулиноподобного рецептора в контексте их влияния на механизмы активации данного рецептора
наука
22.VI Сотрудники Лаборатории биомолекулярной ЯМР-спектроскопии, Лаборатории моделирования биомолекулярных систем, Лаборатории химии протеолитических ферментов ГНЦ ИБХ РАН совместно с коллегами из Центра старения МФТИ и Новосибирского института органической химии имени Н. Н. Ворожцова СО РАН установили новые молекулярные аспекты механизма активации рецепторной тирозинкиназы IRR — рецептора, функционирующего как сенсор внеклеточного щелочного pH.
- III Всероссийская школа-конференция для молодых ученых и студентов «Генетические технологии в исследованиях природных соединений»
конференции
18.VI С 12-го по 17-ое октября 2026 года в г. Владивосток пройдет III Всероссийская школа-конференция для молодых ученых и студентов "Генетические технологии в исследованиях природных соединений". Сайт конференции: https://conference-genetic-technologies.ru/?ysclid=mpwo658kvo136752027 Форма участия : очная / дистанционная. Срок подачи заявок: 25.06.2026 г.
События
- XXXIX международная зимняя молодежная научная школа
конференции
8–11.II.27 Учебно-научный центр Государственного научного центра Института биоорганической химии им. академиков М.М.Шемякина и Ю.А.Овчинникова Российской академии наук (далее - ГНЦ ИБХ РАН) приглашает студентов, аспирантов и молодых ученых в возрасте до 35 лет, проводящих научные исследования в области биоорганической химии, молекулярной биологии, биохимии, биотехнологии и биомедицины, принять участие в работе XXXIX международной зимней молодёжной научной школы "Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии" (далее – Школа-2027). Школа-2027 будет проведена в ГНЦ ИБХ РАН с 8 по 11 февраля 2027 года.
- Семинар отдела молекулярной биологии и биотехнологии растений
наука
6.VII (Событие окончено) В понедельник 6 июля 2026 г. в 15-00 в семинарской комнате на 4 этаже 33 корпуса состоится семинар Отдела молекулярной биологии и биотехнологии растений. Тема семинара: доклад Ерохина Дениса Валерьевича по теме его диссертационной работы "МОЛЕКУЛЯРНЫЕ МЕХАНИЗМЫ СОВМЕСТНОГО ДЕЙСТВИЯ ИНДУЦИРУЮЩИХ БОЛЕЗНЕУСТОЙЧИВОСТЬ РАСТЕНИЙ БЕЛКОВ MF2 И MF3" на соискание степени кандидата биологических наук по специальности 4.1.3. - Агрохимия, агропочвоведение, защита и карантин растений. ГНЦ ИБХ РАН выступает в качестве ведущей организации.
- Семинар Отдела геномики адаптивного иммунитета
наука
7.VII (Событие окончено) Представление диссертации Шугая М.А. «Предсказание антигенной специфичности Т-клеток по репертуарам последовательностей Т-клеточных рецепторов», представляемую на соискание ученой степени д.б.н. по специальности 1.5.8. Математическая биология, биоинформатика. Семинар состоится 07 июля 2026 г. (вторник), в 15.00 в конференц-зале Института, 5 этаж.
