-Генетические РНК-технологии: новый ресурс для развития биологии и биотехнологии растений
РНК-ориентированный подход, разрабатываемый в данном проекте, в отличие от технологии CRISPR-Cas • во-первых, позволяет проводить обратимую модификацию экспрессии генов именно в то время (на той стадии вегетации), когда это необходимо для достижения желаемого эффекта, не затрагивая функции растения (которые часто существенны на других стадиях); существует большое число генов растений, модификация которых определяет полезные признаки только на определённых стадиях развития или в определённых условиях; полная и необратимая модификация (вызываемая CRISPR-Cas редактированием генов) часто влечёт за собой нежелательные последствия; • во-вторых, предлагает прямую защиту от патогенов и вредителей, подавляя экспрессию их геномов; • в-третьих, позволяет быстро и адресно реагировать на экологические вызовы, обусловленные (а)биотическими стрессами в определённой климатической зоне и в определённом сезоне, защищая сельскохозяйственные культуры независимо от сорта (при минимальных затратах времени, средств и труда); • в-четвертых, технически прост, поскольку не использует трудоёмкую процедуру регенерации растений (трудно выполнимую для многих видов и сортов); • наконец, разрабатываемая РНК платформа технологически универсальна для любого сорта целевой сельскохозяйственной культуры Таким образом, настоящий проект предполагает расширить арсенал геномных технологий в биологии растений и растениеводстве, дополнив CRISPR-Cas систему дцРНК-направленной РНКи. Диверсификация систем геномного редактирования в растениеводстве весьма актуальна и направлена на применение инновационных и ресурсосберегающих технологий и снижает риски, связанные с рядом технических и регуляторных ограничений. Проект носит ярко выраженный мультидисциплинарный характер и включает специалистов разных дисциплин: молекулярных биологов, биоинформатиков, вирусологов, фитопатологов, химиков, физиков, нанотехнологов и биотехнологов. Проект включает включает 6 основных взаимосвязанных блоков: I. Рациональное конструирование новых дцРНК и искусcтвенных регуляторных РНК (ART PHK, artificial small RNA-based silencing tools) в качестве инструментов защиты растений и регуляции (редактирования) экспрессии генов растений. II. Поиск новыx генетических мишеней (ключевых белок-кодирующих и некодирующих РНК, пептидов) для придания растениям новых свойств. III. Методы и алгоритмы персонализированного подхода к защитe растений: создание биоинформатической платформы для интеграции глубокой диагностики (NGS) патогенов в систему производства препаратов "защитных" РНК для конкретных вирусных комплексов. IV. Средства контролируемой доставки молекул РНК и пептидов в растения. V. Получение pастений с новыми свойствами при использовании следующих генов-мишеней для РНКи на картофеле: 1. Гены коилина и фибрилларина - устойчивость к вирусам и стрессам (тепло). 2. Ген StCEN - yскорение клубнеобразования. 3. Ген зеаксантин эпоксидазы - повышение содержания диетического каротиноида для функционального питания. 4. Гены, некодирующие РНК, пептиды, идентифицированные в данном проекте VI. На пути к коммерциализации. Маркетинговые исследования в области применения РНК-пептидных технологий в биотехнологии.
January 6, 2023 December 31, 2026
List of publications
- (2023). The Temporal and Geographical Dynamics of Potato Virus Y Diversity in Russia. Int J Mol Sci 24 (19), 14833
- (2023). A Non-Canonical Pathway Induced by Externally Applied Virus-Specific dsRNA in Potato Plants. Int J Mol Sci 24 (21), 15769
- (2023). A Direct Comparison of Peptide Drug Delivery Systems Based on the Use of Hybrid Calcium Phosphate/Chitosan Nanoparticles versus Unmixed Calcium Phosphate or Chitosan Nanoparticles In Vitro and In Vivo. Int J Mol Sci 24 (21), 15532
- (2023). Nanoplatforms for the Delivery of Nucleic Acids into Plant Cells. Int J Mol Sci 24 (23), 16665
- (2023). Bioassays for Identifying and Characterizing Plant Regulatory Peptides. Biomolecules 13 (12), 1795
- (2023). Aqueous Submicron Dispersions of Surfactants as Wetting Agents and Permeability Enhancers of Potato Leaves. RUSS J GEN CHEM 93 (11), 2841–2850
- (2024). 3D-Morphology and properties of carriers based on calcium phosphate and chitosan. Russ Chem Bull 73 (4), 834–841
- (2024). RNAi-Based Approaches to Control Mycotoxin Producers: Challenges and Perspectives. J Fungi (Basel) 10 (10), 682
- (2024). Genomes of Alphanucleorhabdovirus Physostegiae Isolates from Two Different Cultivar Groups of Solanum melongena. Viruses 16 (10), 1538
- (2024). TWEEN 80 AQUEOUS MICELLAR SOLUTIONS AS WETTING AGENTS AND PERMEABILITY ENHANCERS OF POTATO LEAVES. COLLOID J USSR+ 86 (6),
- (2024). Application of Chitosan and Its Derivatives Against Plant Viruses. Polymers (Basel) 16 (22), 3122
- (2024). Calcium Phosphate Nanoparticles as Carriers of Low and High Molecular Weight Compounds. Int J Mol Sci 25 (23), 12887
- (2024). Identification of Two Novel Recombinant Types of Potato Virus Y from Solanum tuberosum Plants in Southern Region of Russia. PLANT DIS 109 (5), 998–1003
- (2024). Aqueous Tween 80 Micellar Solutions as Wetting Agents and Permeability Enhancers of Potato Leaves. Colloid Journal of the USSR (English Translation of Kolloidnyi Zhurnal) 86 (6), 867–873
- (2025). Poly ADP-Ribosylation in a Plant Pathogenic Oomycete Phytophthora infestans: A Key Controller of Growth and Host Plant Colonisation. J Fungi (Basel) 11 (1), 29
- (2025). Efficient Method to Isolate High-Quality RNA from Mycelia of Toxigenic Fungi Fusarium sp. Mol Biol 59 (2), 285–292
- (2025). Biotechnological Approaches to Plant Antiviral Resistance: CRISPR-Cas or RNA Interference? Biochemistry (Mosc) 90 (6), 804–817
- (2025). The Emerging Role of Omics-Based Approaches in Plant Virology. Viruses 17 (7), 986
- (2025). CaP Nanoparticles Improve the Effect of dsRNA on Gene Expression, Growth, and Mycotoxin Production of Toxigenic Fusarium graminearum. Int J Mol Sci 26 (20), 10021
- (2025). Discovery and Identification of Plant Regulatory Peptides. Russ. J. Bioorganic Chem. 51 (5), 1838–1852
- (2025). Inorganic nano- and microparticles: methods for the preparation and possible applications in plant growing. Russ Chem Bull 74 (10), 2947–2969
- (2025). Potato Elicitor Peptide StPep1 Enhances Resistance to Phytophthora infestans in Solanum tuberosum. J Fungi (Basel) 11 (12), 893
- (2026). The Distribution and Genetic Variability of Potato Viruses in Russian Regions. Acta Naturae 18 (1), 91–103
- (2026). Exogenous Application of Cellulose-Based Materials for Improved Plant Fitness. Int J Mol Sci 27 (17), 7629
- (2026). Synthetic Potato Systemin Enhances Solanum tuberosum Resistance to Potato Virus Y. Biomolecules 16 (9), 1353

