Анализ эволюции микробелков, кодируемых длинными некодирующими РНК у растений
Транскрипция эукариотических геномов приводит к образованию тысяч длинных некодирующих РНК (длнкРНК), функции большинства которых неизвестны. Хотя длнкРНК не кодируют белков, короткие открытые рамки считывания (кОРС, 100 кодонов), расположенные на них, потенциально могут кодировать микробелки. Используя транскриптомы 479 видов растений, команда ученых из ИБХ РАН, ФНКЦ ФХМ и группы эволюционного анализа (NIH, Бетесда, США) под руководством Евгения Кунина, изучила консервативность и эволюцию кОРС, предсказанных на длнкРНК модельного растения Physcomitrium patens. Было обнаружено, что тысячи эволюционно молодых кОРС находятся под действием отрицательного отбора. Прямое нанопоровое секвенирование РНК показало, что уровень транскрипции консервативных кОРС был значительно выше чем у неконсервативных. Трансляция некоторых из этих кОРС была подтверждена экспериментально. Полученные данные расширяют представления о эволюции этого типа кОРС у растений. Работа опубликована в журнале Nucleic Acids Research.
1 октября 2021 года