В современной клинической практике распространение микроогранизмов с устойчивостью к известным препаратам представляет собой нарастающую проблему. Развитие внутрибольничных инфекций с высокой патогенностью и множественной лекарственной устойчивостью ставит под угрозу саму возможность проведения инвазивных вмешательств, особенно для пациентов с подавленным иммунитетом (например, при трансплантации органов). Природные соединения являются основой большинства лекарственных препаратов, поэтому разработка новых антимикробных агентов с оригинальными механизмами действия представляет собой актуальную задачу. Классические методы скрининга, позволившие обнаружить большинство известных классов биоактивных метаболитов, все чаще приводят к переоткрытию известных молекул. Один из путей решения этой проблемы является изучение так называемой «микробной темной материи» - обширной фракции природного биооразнообразия, не поддающейся культивированию в стандартных лабораторных условиях. Этот проект направлен на разработку микрофлюидной платформы для суспензионного культивирования микробиоты для поиска новых биоактивных метаболитов микроорганизмов, в том числе из малоизученных местообитаний. Разработанная в рамках проекта совокупность подходов позволит выделять и культивировать микробные сообщества из природных источников, стимулировать биосинтез вторичных метаболитов и изучать взаимодействие микроорганизмов на уровне отдельных клеток. Метод нанофракционирования и профилирования по биоактивности позволит исследовать метаболом суспензионных культур при небольших объемах культивирования. Исследование метаболома ранее некультивируемых организмов позволяет ожидать выявления уникальных по структуре и эффекторым свойствам метаболитов и открывает широкие перспективы для обнаружения оригинальных молекул с различными ценными фармакологическими свойствами.