Пресс-центр / новости / Наука /

Модель трансмембранного домена S-белка SARS-CoV-2, обладающая уникальной стабильностью

Инструменты, разработанные в Лаборатории моделирования биомолекулярных систем ИБХ РАН, легли в основу комплексного подхода для создания модели трансмембранного домена (ТМД) S-белка SARS-CoV-2.

Кроме построения на шаблоне использовались анализатор молекулярного гидрофобного потенциала (МГП) Platinum, утилита для предсказания структуры димеров PREDDIMER и подстройка “динамических МГП портретов” при расчете молекулярной динамики. Итоговая модель - единственная созданная с учетом липидного окружения и принципов упаковки α-спиральных ТМД - оказалась чрезвычайно устойчива в модельном бислое, больше, чем альтернативные модели и недавно опубликованная ЯМР-структура, в том числе при ацилировании лежащих ниже ТМД остатков.

Работа опубликована в журнале International Journal of Molecular Sciences.

 

31 августа