Наука ИнтервьюАдминистрацияКонференцииПрофкомУчебный центрАспирантураБиблиотекаСМУДиссертационный советКафедра МФТИКафедра МГУОтчетыГрантыЖилищная комиссия

• Различие структурно-динамических свойств и взаимодействий с липидным окружением объясняет особую функциональную роль трансмембранных доменов в подсемействе рецепторов инсулина 28 февраля

  Рецепторные тирозинкиназы InsR, IGF1R и IRR подсемейства рецепторов инсулина играют важную роль в межклеточных сигнальных путях различных физиологических процессов. Имея высокую гомологию последовательности и структуры, рецепторы не схожи по своей локализации, экспрессии и функциям в организме человека. Команда ученых из ИБХ РАН в сотрудничестве с коллегами из других институтов с помощью ЯМР-спектроскопии высокого разрешения и компьютерного моделирования установила, что конформационная изменчивость трансмембранных доменов и их взаимодействие с окружающими липидами существенно различаются у представителей подсемейства.

• Оценка неоднородности структуры поверхности наночастиц ядро-оболочка с помощью изменения контраста МУРР и моделирования ab initio 24 февраля

  Группа учёных из Лаборатории молекулярной биофизики и Лаборатории углеводов ИБХ РАН в коллаборации с коллегами из Института кристаллографии имени А.В. Шубникова РАН и Европейской молекулярно-биологической лаборатории (Гамбург) разработала новый подход в исследовании структуры наночастиц, сочетающий методы МУРР и молекулярной динамики.

• Bet v 1-независимая сенсибилизация иммунной системы человека аллергенами из пыльцы деревьев отряда Fagales 13 февраля

  Группа учёных из Отдела «Учебно-научный центр» ИБХ РАН и Центра патофизиологии, инфектологии и иммунологии Венского медицинского университета доказали, что основные аллергены из пыльцы деревьев отряда Fagales, в том числе Aln g 1 ольхи, обладают способностью вызывать независимую от Bet v 1 из пыльцы берёзы сенсибилизацию иммунной системы у пациентов, проживающих в районах с преобладанием берёзы.

• Двухстадийная адресная доставка наночастиц, загруженных доксорубицином, к клеткам со сверхэкспрессией рецептора HER2 посредством белковой пары барназа-барстар превосходит одностадийную адресную доставку 1 февраля

  Группа учёных из Лаборатории молекулярной иммунологии ИБХ РАН и Лаборатории биохимических исследований канцерогенеза МФТИ показали преимущество двухстадийной адресной доставки лекарств на основе пары барназа-барстар перед одностадийной адресной доставкой.

• Магнитно-полимерные наночастицы, модифицированные лектинами, для фотодинамической терапии in vivo 1 февраля

  Для многих видов онкологических заболеваний характерны высокая агрессивность и летальность, что приводит к необходимости разработки новых стратегий терапии, в частности, на основе «умных» материалов. Одной из таких стратегий является адресная доставка наночастиц к специфическим рецепторам на поверхности раковых клеток, однако, на сегодняшний день не существует адресных нанопрепаратов, успешно прошедших клинические испытания. На пути решения этой проблемы коллективом Лаборатории молекулярной иммунологии ИБХ РАН, Лаборатории биохимических исследований канцерогенеза МФТИ и отдела нанобиомедицины Университета Сириус, был разработан альтернативный способ онкотерапии.

• RALF пептиды регулируют иммунный ответ у мха Physcomitrium patens 1 февраля

  Растения используют малые секретируемые пептиды в качестве важных медиаторов многих процессов, от роста и развития до реакции на стрессовые условия. Одним из таких регуляторов является семейство консервативных цистеин-богатых 5 кДа пептидов RALF (Rapid Alkalinization Factor), широко представленных у наземных растений. Это семейство пептидов значительно расширилось в ходе эволюции наземных растений, но роль древних RALF в регуляции ответа на стресс всё ещё неизвестна.

• Конъюгаты фрагментов антител с лекарствами селективно уничтожают GD2-экспрессирующие опухолевые клетки 26 января

  Использование фрагментов антител вместо полноразмерных антител в конъюгатах с лекарствами способно ускорить накопление терапевтических молекул в опухоли и снизить их побочные эффекты. Сотрудники Лаборатории молекулярной иммунологии совместно с коллегами из Лаборатории клеточных взаимодействий и Лаборатории молекулярной диагностики ИБХ РАН, а также из других российских институтов, впервые получили конъюгаты фрагментов GD2- специфичных антител с лекарствами. Конъюгаты миниантител и scFv-фрагментов антител с тубулин-ингибирующими препаратами MMAE и MMAF проявили сильные цитотоксические и цитостатические эффекты в GD2-положительных линиях нейробластомы и меланомы.

• Получена серия противовирусных соединений на основе 5-(перилен-3-илэтинил)урацила и изучен их механизм действия 23 января

  Группа учёных из Лаборатории молекулярного дизайна и синтеза, Группы экспрессии белковых факторов роста и дифференцировки ИБХ РАН, Института полиомиелита и других институтов синтезировали серию соединений на основе 5-(перилен-3-илэтинил)урацила и изучили их противовирусные свойства и механизм действия. Предыдущие исследования данного класса соединений предполагали противоречащие типы механизмов действия при сопоставимо высокой активности. Настоящее исследование показало, что при облучении светом амфифильные соединения, аккумулированные в клеточных и вирусных мембранах, ингибируют проникновение в клетку оболочечных вирусов.

• Профаговые области в куртобактериальных геномах: мал золотник, да дорог 23 января

  Curtobacterium — род грамположительных бактерий порядка Actinomycetales. Некоторые виды Curtobacterium являются патогенами сельскохозяйственных культур, таких как соя, сухие бобы, горох, сахарная свекла и столовая свекла, которые встречаются во всем мире. Около 200 геномов видов Curtobacterium, включая метагеномные последовательности, были проверены на наличие последовательностей возможного профагового происхождения.

• Использование комплексного подхода, включающего предсказания AlphaFold, для эволюционной таксономии вирусов реалма Duplodnaviria 18 января

  Классификация высокоранговых таксонов, включая семейства и отряды – важная задача для таксономии вирусов реалма Duplodnaviria. В настоящем исследовании сотрудники Лаборатории молекулярной инженерии ИБХ РАН совместно с коллегами из Лимнологического института СО РАН проанализировали эволюционные отношения консервативных вирусных белков, представляющих различные вирусы, включая все классифицированные семейства Duplodnaviria.

• Хемогенетически индуцированный окислительный стресс в нейронах снижает синаптическую пластичность 16 января

  Сотрудники Группы редокс-биологии и Лаборатории молекулярных технологий Отдела метаболизма и редокс-биологии ИБХ РАН совместно с коллегами из ФЦМН ФМБА России и РНИМУ им. Н.И. Пирогова показали на модели долговременной потенциации, что окислительный стресс в нервных клетках подавляет синаптическую пластичность.

• Видеозапись семинара «Молекулярный мозг». Эпилепсия и каналопатии: от молекулярных механизмов в клинику и обратно 13 января

  Три доклада были посвящены современному пониманию эпилепсии и каналопатий и рассматривали различные аспекты: молекулярные и физиологические механизмы, а также подходы к терапии. Семинар состоялся 22 сентября 2022 года.

• ИБХ РАН получил поддержку Минобрнауки России на обновление приборной базы в 2023 году 13 января

  Министерство науки и высшего образования РФ объявило получателей грантов на обновление приборной базы в 2023 году в рамках федерального проекта «Развитие инфраструктуры для научных исследований и подготовки кадров» национального проекта «Наука и университеты». Лидерами конкурса стали МГУ имени М.В. Ломоносова и Физический институт имени П. Н. Лебедева РАН. ИБХ РАН вместе с еще 5 организациями, подведомственными Минобрнауки, заняли почетное третье место по объему выделенных средств среди 200 участников.

• Научные достижения ИБХ РАН в 2022 году 29 декабря 2022 года

  На заседании Ученого Совета ИБХ РАН 29 декабря 2022 г. были представлены результаты научной деятельности подразделений Института за 2022 год. Вашему вниманию предлагается презентация директора А.Г. Габибова, а также список  достижений, поданных подразделениями на сайте.

• Изучено влияние старения контрастных наночастиц для МРТ в организме 22 декабря 2022 года

  Группа ученых из Лаборатории молекулярной иммунологии ИБХ РАН, ИОФ РАН и ряда других научных институтов провели исследование биотрансформации магнитных наночастиц в организме и влияния этого процесса как на метаболизм железа, так и на уменьшение контрастных свойств наночастиц при визуализации. Долгое время оставалось неясным, что в долгосрочной перспективе происходит с наночастицами-контрастами для МРТ после их распределения по тканям, при том, что процессы биодеградации наноматериалов, сопровождающиеся обильным выделением ионов железа, могут токсически влиять на сам организм. Новое исследование, опубликованное в высокорейтинговом журнале Journal of Nanobiotechnology, позволило прояснить этот вопрос.

• Важность международного признания результатов неклинических исследований для выхода на мировой рынок 21 декабря 2022 года

  На сайте GxP опубликовали статью Аркадия Мурашева, заведующего Отделом биологических испытаний ИБХ РАН, посвященную важности международного признания результатов неклинических исследований для выхода на мировой рынок. Предлагаем всем желающим ознакомиться со статьей по ссылке: https://gxpnews.net/2022/12/vazhnost-mezhdunarodnogo-priznaniya-rezultatov-neklinicheskih-issledovanij-dlya-vyhoda-na-mirovoj-rynok/

• Конкурс молодых микробиологов на лучшую статью 2022 года (ММО-22)) - до 20 января 2023 20 декабря 2022 года

  Межрегиоральное Микробиологическое Общество объявляет конкурс молодых микробиологов (ММО-22) на лучшую статью 2022г.  PDF-файл статьи, графические абстракты к ним посылать на адрес ММО rms@fbras.ru до 20 января 2023г.

• Российские биологи открыли новый тип взаимодействия змеиных α-нейротоксинов с никотиновыми ацетилхолиновыми рецепторами 14 декабря 2022 года

  Коллектив российских биологов с участием сотрудников ИБХ РАН, НИЦ «Курчатовский Институт», Института биомедицинской химии и биологического факультета МГУ имени М.В. Ломоносова изучил, как взаимодействуют змеиные «необычные» α-нейротоксины с никотиновыми ацетилхолиновыми рецепторами животных.

• Идентификация эпитопов, распознаваемых Т-клеточным рецептором, ассоциированным с анкилозирующим спондилитом 13 декабря 2022 года

  Анкилозирующий спондилоартрит (АС) – ревматологическое заболевание аутоиммунной природы. В основе развития аутоиммунных патологий лежит реализация иммунного ответа организма против антигенов собственных клеток. Идентификация антигенов, распознаваемых рецепторами Т-лимфоцитов, в особенности аутоантигенов, на данный момент представляет технологически весьма сложную задачу. К настоящему времени удалось охарактеризовать антигенную специфичность буквально лишь нескольких таких Т-клеточных рецепторов (TCR). При этом получаемые сведения совершенно необходимы как для понимания общих правил распознавания Т-клетками специфических антигенов, так и для понимания механизма развития аутоиммунного заболевания и разработки терапевтических подходов подобных состояний.

• Лекция «Геномное редактирование» в рамках лектория «Научная среда» состоится 14 декабря 12 декабря 2022 года

  Константин Викторович Северинов, профессор Сколтеха и Ратгерского университета, заведующий лабораториями в Институте молекулярной генетики Национального исследовательского центра «Курчатовский институт» и в Институте биологии гена РАН, расскажет о геномном редактировании CRISPR-CAS. Начало мероприятия в 17:30 (аудитория А1). Регистрация возможна по ссылке: http://service.rsmu.ru/track/redirect/c0c42afe009396244b20be64cb7bb93d3e66f1a527003d270eccde9527044f33  Для тех, кто не сможет присутствовать, будет доступна онлайн-трансляция в ZOOM. Всю информацию об онлайн-трансляции можно получить по ссылке ниже. 

• Обучение в Школе математического моделирования в фармацевтике 21 ноября 2022 года

  Мы приглашаем молодых специалистов в области фармации, медицины, биологии, биоинженерии, статистики, математики и смежных дисциплин на Школу математического моделирования в фармацевтике, которая откроется 5 декабря 2022 года.

• Взаимосвязь фенольных соединений и антиоксидантной активности в ягодах и листьях генотипов малины и их генотипирование с помощью SSR маркеров 21 ноября 2022 года

  В последние годы в селекции растений усиленное развитие получило направление обогащения фруктов и ягод биологически активными веществами, в частности, антиоксидантами (создание functional food). Сотрудники Группы лесной биотехнологии ФИБХ РАН совместно с коллегами из других институтов изучили содержание полезных для здоровья веществ - общих фенолов, флавоноидов и антоцианов, а также их связь с антиоксидантной активностью в ягодах и листьях различных сортов малины российской и зарубежной селекции, в том числе и новых селекционных линий.

• Лекция «Искусственный интеллект в молекулярных науках о здоровье» 21 ноября 2022 года

  Во вторник, 22 ноября, в РНИМУ им. Н.И. Пирогова Минздрава России пройдет лекция «Искусственный интеллект в молекулярных науках о здоровье». Ее прочитает ректор АНО «Сириус», доктор химических наук, член-корреспондент РАН Федоров Максим Валериевич. Мероприятие состоится в рамках проекта «Научная среда» в аудитории А1. Начало в 18:30. Чтобы принять участие в лекции, зарегистрируйтесь на сайте Университета.

• Наночастицы пожертвовали собой для улучшения доставки лекарств 18 ноября 2022 года

  “Живи ярко, умри молодым” – не только лозунг рок-культуры, но и принцип, который вошел в новый метод доставки лекарств. В недавней работе российских ученых, опубликованной в престижном журнале Nature Communications, было показано, что наночастицы, которые саморазрушаются в течение всего нескольких минут в организме могут осуществлять эффективную терапию метастаз в легких (Рисунок 1).

• Времяразрешенный флуоресцентный GFP-индикатор для точных измерений рН в щелочном диапазоне 17 ноября 2022 года

  Мониторинг внутриклеточного pH в живых клетках с высокой точностью в режиме реального времени представляет собой важную методологическую задачу. Хотя генетически кодируемые флуоресцентные индикаторы предпочтительны для таких измерений, они в основном неспособны определить абсолютное значение рН и/или обладают узким динамическим диапазоном ответа, что делает их неэффективными для регистрации небольших изменений рН, которые обычно происходят в клеточных органеллах.

• Лекция акад. Габибова А.Г. "Комбинаторная химия и биология в исследовании биоразнообразия" - 5.12.22. в 11 ч в ИМБ РАН 14 ноября 2022 года

  5 декабря 2022г. в 11 ч в конференц-зале ИМБ  РАН им. акад.  В.А. Энгельгардта состоится лекция акад. Габибова А.Г. "Комбинаторная химия и биология в исследовании биоразнообразия" - 36 Энгельгардтовское чтение.

• Открытый семинар группы "Структурной организации Т-клеточного иммунитета", 21 ноября 2022 года 14 ноября 2022 года

  21 ноября, в 11.00 состоится открытый  семинар группы "Структурной организации Т-клеточного иммунитета". Тема - предзащита диссертации Израельсона М. А. "Организация адаптивного иммунитета долгоживущего грызуна Spalax galili" на соискание ученой степени кандидата биологических  наук.

• Выпуск № 6, 2022 журнала «Биоорганическая химия» 24 октября 2022 года

  Уважаемые коллеги! Для просмотра доступны полные тексты статей № 6, 2022 журнала «Биоорганическая химия» (раздел «Архив номеров»).

• О формирования специального номера журнала «Биоорганическая химия», посвященного памяти академика В.Т. Иванова 16 октября 2022 года

  Редакционная коллегия журнала «Биоорганическая химия» извещает о начале формирования специального номера журнала, посвященного памяти академика В.Т. Иванова. Выход спецномера в свет запланирован на январь 2023 г. К участию в формировании спецномера приглашаются все научные подразделения ИБХ и ФИБХ РАН. Просьба до 31 октября 2022 г. сообщить по адресу ovch@bk.ru о Вашем намерении представить в ноябре 2022 г. обзор или экспериментальную статью для включения в спецномер. Авторам рукописей, получивших положительные отзывы рецензентов, будет направлено письмо-подтверждение о принятии в печать для включения в отчетную документацию по грантам за 2022 г.   С уважением, Т.В. Овчинникова, член редколлегии журнала

• Долгосрочная динамика клонального репертуара Б-лимфоцитов: персистирование клонов Б-клеток памяти и позитивная селекция при реактивации и дифференцировке в антитело-секретирующие популяции 12 октября 2022 года

  Сохранение клонов Б-клеток и возможность тонкой «подстройки» специфичности их рецептора (BCR) к изменениям в структуре антигена позволяет эффективно развивать иммунный ответ в случае повторного контакта с патогенами. Группа ученых из Отдела геномики адаптивного иммунитета ИБХ РАН, совместно с коллегами из ИППИ и Сколтеха, охарактеризовали свойства и динамику репертуаров BCR Б-клеток памяти, и антитело- секретирующих клеток здоровых доноров в течение длительного периода наблюдения.

• Выпуск № 5, 2022 журнала «Биоорганическая химия» 19 сентября 2022 года

  Уважаемые коллеги! Для просмотра доступны полные тексты статей № 5, 2022 журнала «Биоорганическая химия» (раздел «Архив номеров») и тексты статей №4, 2022 Russian Journal of Bioorganic Chemistry (Volume 48, Issue 4).

• Модель трансмембранного домена S-белка SARS-CoV-2, обладающая уникальной стабильностью 31 августа 2022 года

  Инструменты, разработанные в Лаборатории моделирования биомолекулярных систем ИБХ РАН, легли в основу комплексного подхода для создания модели трансмембранного домена (ТМД) S-белка SARS-CoV-2.

• Рецепторная тирозинкиназа IRR регулирует скорость раннего развития Xenopus laevis 18 августа 2022 года

  Сотрудники Лаборатории молекулярных основ эмбриогенеза, Лаборатории клеточной биологии рецепторов и Группы молекулярной физиологии ИБХ РАН совместно с коллегами из Федерального исследовательского центра «Фундаментальные основы биотехнологии» РАН, Swiss Federal Institute of Technology Lausanne (EPFL) и European Bioinformatics Institute впервые продемонстрировали, что рецепторная тирозинкиназа IRR регулирует скорость раннего развития шпорцевой лягушки Xenopus laevis.

• Влияние применения экзогенной дцРНК против Y вируса картофеля на РНК интерференцию, неспецифический иммунитет и метаболизм поли(АДФ-рибозы) в растениях картофеля 15 августа 2022 года

  В настоящее время активно разрабатываются методы ингибирования вирусной инфекции, индуцированные опрыскиванием растений препаратами специфических двуцепочечных РНК (дцРНК). Сотрудники Лаборатории функциональной геномики и протеомики растений, Лаборатории Молекулярной диагностики и Лаборатории молекулярных основ стрессоустойчивости растений ИБХ РАН совместно с коллегами из ООО «Дока-Генные Технологии» изучили вклад двух механизмов, индуцируемых дцРНК (специфической РНК-интерференции и неспецифического иммунитета), в противовирусную защиту растений картофеля при использовании дцРНК Y вируса картофеля.

• Транскрипционный фактор SOX9 клеточно-специфическим образом регулирует множество клеточных процессов и сигнальных путей при раке поджелудочной железы 12 августа 2022 года

  Протоковая аденокарцинома поджелудочной железы является одним из самых смертоносных видов рака во всем мире. В большинстве случаев протоковой аденокарциномы поджелудочной железы наблюдается повышенная экспрессия гена SOX9. Авторы работы предположили, что повышенная экспрессия критического фактора развития поджелудочной железы SOX9 необходима для формирования и поддержания опухолевых фенотипов в клетках рака поджелудочной железы.

• Мамбалгин-2 ингибирует рост и миграцию аденокарциномы легкого за счет селективного взаимодействия с гетеротримером ASIC1/α-ENaC/γ-ENaC 5 августа 2022 года

  Рак легких является одним из самых распространенных видов рака в мире. Несмотря на существующие стратегии лечения, общая выживаемость пациентов остается низкой, и требуются новые таргетные методы лечения. Ранее сотрудниками Лаборатории биоинженерии нейрорецепторов и нейромодуляторов ИБХ РАН было показано, что ингибирование кислоточувствительных каналов, содержащих субъединицу ASIC1, рекомбинантным аналогом трехпетельного токсина мамбалгина-2 из яда Dendroaspis polylepis останавливает онкогенные процессы в клетках лейкемии, глиомы и меланомы.

• Терапевтическая эффективность конъюгатов антител c лекарствами в GD2-экспрессирующих опухолях 19 июля 2022 года

  За последние несколько лет GD2-направленная иммунотерапия и конъюгаты антител с лекарствами, как класс таргетных препаратов, продемонстрировали высокую эффективность в терапии солидных опухолей, однако практически отсутствуют исследования, посвященные конъюгатам антител с лекарствами, направленными на опухолеассоциированный маркер ганглиозид GD2. Сотрудники Отдела иммунологии ИБХ РАН совместно с коллегами из других российских институтов впервые показали, что конъюгаты GD2-специфичных антител с лекарствами проявляют высокую и селективную цитотоксичность на широкой панели GD2-экспрессирующих опухолевых клеточных линий, а также сильно ингибируют рост солидных опухолей в GD2-положительных мышиных моделях рака.

• Синтез новых 5'-норкарбоциклических аза/дезазапуриновых флексимеров - неконкурентных ингибиторов пуриннуклеозидфосфорилазы E. coli 11 июля 2022 года

  Сотрудниками Лаборатории биосинтеза низкомолекулярных физиологически активных соединений и Лаборатории биофармацевтических технологий (ИБХ РАН) совместно с коллегами из Института молекулярной биологии им. В. А. Энгельгардта синтезирована новая серия флексимерных 5'-норкарбоциклических аза/дезаза-пуриновых аналогов нуклеозидов и исследована их ингибирующая способность по отношению к пуриннуклеозидфосфорилазе E. coli.

• Производные тушителей флуоресценции семейства black hole quencher, несущие положительный заряд, в качестве внешних SERS-активных чувствительных элементов биосенсоров 8 июля 2022 года

  Сотрудники Группы молекулярных инструментов для исследования живых систем (ИБХ РАН), кафедры природных соединений химического факультета МГУ и Института физики твердого тела имени Ю.А. Осипьяна, при участии Лаборатории молекулярного дизайна и синтеза (ИБХ РАН), разработали внешние SERS-активные чувствительные элементы на основе производных black hole quencher, несущие положительный заряд.

• Лигнаны как фармакологические агенты при расстройствах, связанных с окислительным стрессом и воспалением: подходы химического синтеза и биологическая активность 5 июля 2022 года

  Растительные лигнаны – активные компоненты многих лекарственных растений, что делает их привлекательным объектом разработки в качестве терапевтических агентов для практического применения. Структурное разнообразие обуславливает наличие большого числа естественных фармакофоров, что позволяет им взаимодействовать с различными ферментами, рецепторами, ионными каналами и сигнальными молекулами.

• Стрептоциннамиды А и В, депсипептиды из штамма Streptomyces sp. KMM 9044 1 июля 2022 года

  Новая структурная группа антибиотиков из нового штамма-продуцента Streptomyces sp. КММ 9044 открыта в результате совместной работы сотрудников ИБХ РАН и коллег из Тихоокеанского института биоорганической химии им. Г.Б. Елякова (ТИБОХ РАН).

• Обновленный импакт-фактор английской версии журнала «Биоорганическая химия» 29 июня 2022 года

  Глубокоуважаемые коллеги, авторы и читатели журнала «Биоорганическая химия»! Рады сообщить, что импакт-фактор английской версии журнала Russian Journal of Bioorganic Chemistry увеличился и составил 1,254.

• Выпуски №3 и 4, 2022 журнала «Биоорганическая химия» 28 июня 2022 года

  Уважаемые коллеги! Для просмотра доступны полные тексты № 3 и 4 за 2022 журнала «Биоорганическая химия» (раздел «Архив номеров»).

• Деполимеразы, полученные из областей профага Acinetobacter baumannii, гидролизующий капсульные полисахариды 16 июня 2022 года

  Команда ученых из Лаборатории молекулярной биоинженерии ИБХ РАН совместно с коллегами из других российских институтов были предсказала и получила несколько различных рекомбинантных деполимераз, закодированных в профаговых областях генома Acinetobacter baumannii. Для двух деполимераз определена специфичность к капсулярным полисахаридам (КПС) A. baumannii, относящимся к капсульным типам К1 и К92 (К-типы). Эти ферменты можно рассматривать как подходящие кандидаты для разработки новых антибактериальных средств против соответствующих типов K A. baumannii.

• Эволюция чехольных белков бактериофагов 16 июня 2022 года

  Группа ученых из Лаборатории молекулярной биоинженерии ИБХ РАН с помощью нового программного обеспечения AlphaFold 2 смоделировала и проанализировала 112 сократительных белков оболочки хвоста фага (TShP), представляющих различные группы бактериофагов и архейных вирусов с миовирусной морфологией. Было показано, что общий домен всех исследованных белков оболочки, включая вирусные белки и белки ССТТ, включает как N-концевую, так и С-концевую части, тогда как остальные части состоят из одного или нескольких умеренно консервативных доменов, полученных в ходе эволюции бактериофагов.

• Неоднородность ландшафта приспособленности GFP и дизайн белков на основе алгоритмов машинного обучения 16 июня 2022 года

  Понимание взаимосвязи между генотипом и фенотипом — ландшафтом приспособленности — проясняет фундаментальные законы наследственности (Canale et al., 2018) и может в конечном итоге создать новые методы дизайна белков (Alley et al., 2019). Ландшафт приспособленности часто представляют в виде многомерной поверхности (Kondrashov and Kondrashov, 2015), одним измерением которой является приспособленность или фенотип, а другие измерения — локусы генотипа.

• Синтез рибозидов 2-хлорпурина с амидами хиральных аминокислот в положении С6 и их оценка в качестве агонистов аденозиновых рецепторов А1 типа 14 июня 2022 года

  Команда ученых из Отдела биотехнологии и Лаборатория структурной биологии ионных каналов ИБХ РАН синтезировала серию новых аналогов аденозина – производных 2-хлорпурин-рибозида, содержащих в положении С6 амиды аминокислот и провела молекулярный докинг по их сродству к аденозиновым рецепторам типа А1 (A1AR).

• Белок цитоскелета Zyxin ингибирует передачу сигналов ретиноевой кислоты путем дестабилизации материнской мРНК ядерного рецептора RXRγ 20 мая 2022 года

  Сотрудники Лаборатории молекулярных основ эмбриогенеза ИБХ РАН продемонстрировали универсальность открытого ими ранее механизма регуляции дестабилизации мРНК материнских генов за счет образования комплекса между цитоскелетным белком Zyxin и мРНК-связывающим фактором Ybx1, показав, что с помощью этого же механизма происходит регуляция сигнального пути ретиноевой кислоты во время раннего эмбрионального развития.

• Хемодивергентная спироциклизация вторичных 2-аминобензилиденимидазолонов: катализ кислотами Льюиса в сравнении с кислотами Бренстеда 19 апреля 2022 года

  В современной химии очень востребованной становится концепция так называемой "зеленой химии", то есть таких химических превращений, которые подразумевают минимальное воздействие на окружающую среду. Помимо использования менее токсичных реагентов, менее жестких условий и увеличения выходов реакции, одном из важнейших принципов "зеленой химии" является так называемая "экономия атомов". Этим термином обозначают разработку таких химических реакций, в которых происходит минимальное изменение брутто формулы между исходными веществами и продуктами, что подразумевает минимальное образование побочных продуктов, а значит и минимальное образование отходов.

• Выпуск № 2, 2022 журнала «Биоорганическая химия» 6 апреля 2022 года

  Уважаемые коллеги! Для просмотра доступны полные тексты № 2, 2022 журнала «Биоорганическая химия» (раздел «Архив номеров»).

• Внеклеточные везикулы, выделенные из закисленного окружения первичной метастазирующей меланомы, стимулируют рост, миграцию и стволовость нормальных кератиноцитов 4 апреля 2022 года

  Метастазирующая меланома является высокозлокачественной опухолью. Клетки меланомы выделяют внеклеточные везикулы (экзосомы), которые способствуют росту, метастазированию и злокачественной трансформации соседних клеток за счет переноса миРНК, мРНК и белков, способствующих развитию опухоли. Закисление микроокружения меланомы способствует прогрессированию опухоли и определяет свойства EV.

• Студенты магистерской программы «Структурная биология и биотехнология» стали лауреатами первой ежегодной стипендии «Хеликон» 31 марта 2022 года

  Российский поставщик продукции и сервисных услуг для лабораторий, компания «Хеликон», объявил об учреждении ежегодной именной стипендии для талантливых молодых биологов. Первыми стипендиатами стали студенты магистерской программы «Структурная биология и биотехнология». Она реализуется с 2020 года на базе биологического факультета Московского университета, Института биоорганической химии имени академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова, Центра компетенций НТИ ИБХ РАН и ряда ведущих научных институтов.