Чудаков Дмитрий Михайлович

Личная информация

Окончил Московский Государственный Университет им. М. В. Ломоносова. Работает в ИБХ РАН с 2000 года. Защитил кандидатскую (2003 год) и докторскую (2011 год) диссертации по разработке и применению генетически кодируемых флуоресцентных инструментов. С 2011 года возглавляет лабораторию Геномики адаптивного иммунитета ИБХ РАН.

 

Образование

Период обученияСтрана, городУчебное заведениеДополнительная информация
1995–2000 Россия, Москва МГУ им. Ломоносова

Премии и заслуги

1. Медаль Российской академии наук с премией для молодых ученых РАН, 2005 г.

2. Медаль Европейской Академии наук, 2006 г.

3. Лауреат программы "Выдающиеся ученые. Кандидаты и доктора наук РАН", 2006-2007, 2008-2009 гг.

4. Диплом I степени МАИК за лучшую публикацию в журнале «Биоорганическая химия» за 2008 год.

5. Премия  конкурса МАИК «Наука/Интерпериодика» на лучшую публикацию по биологическим наукам за 2008 год.

6. Диплом за лучшую публикацию в журналах РАН за 2008 год.

7. Диплом II степени МАИК за лучшую публикацию в журнале «Биоорганическая химия» за 2011 год.

8.Диплом за лучшую публикацию в журналах РАН за 2011год.

9. Диплом за наиболее цитируемую за 2011 год публикацию в журналах группы BJ Cell.

10. Премия Президента Российской Федерации для молодых ученых в области науки и инноваций за 2012 год

 

Основные научные результаты

Расшифровал механизм обратимой фотоактивации флуоресценции, подразумевающий цис-транс изомеризацию хромофора, и получил целый ряд так называемых фотоактивируемых белков с высоким контрастом активации. Флуоресцентные характеристики таких белков могут обратимо либо необратимо изменяться в ответ на облучение светом определенной длины волны, что предоставляет уникальные возможности для прицельной маркировки и слежения за живыми объектами, а также для технологий флуоресцентной микроскопии сверх-высокого разрешения.

Разработал палитру ярких мономерных флуоресцентных белков, флуоресцирующих в диапазоне всего видимого спектра и позволяющих проводить многоцветное мечение молекул в живых клетках: TagBFP, TagCFP, TagGFP, TagYFP, TagRFP, а также дальне-красные белки mKate и mKate2. Белок TagRFP является самым ярким из разработанных мономерных красных флуоресцентных белков, существенно опережая немногие имеющиеся аналоги, и хорошо зарекомендовал себя в химерных конструкциях с различными исследуемыми белками. Белок mKate2 является абсолютным лидером по яркости среди мономерных дальне-красных флуоресцентных белков.

Разработал яркие быстро созревающие белки: TurboGFP, TurboYFP, TurboRFP, TurboFP602, а также яркий дальне-красный белок Катюша (Katushka, TurboFP635). Уникальное для флуоресцентных белков сочетание высокой яркости и длинноволнового излучения позволяет эффективно детектировать сигнал Катюши в живых тканях, проницаемость которых повышена в дальне-красной области спектра. Катюша существенно повышает чувствительность технологий прижизненной визуализации клеток и тканей в интактных трансгенных организмах, и в перспективе может найти свое применение в практической медицине.

Получил ряд высоко-контрастных генетически кодируемых сенсоров на основе флуоресцентных белков, в том числе сенсоров концентрации кальция, сенсоров программируемой клеточной гибели.

С участием Чудакова Д. М. получен первый и единственный на сегодняшний день генетически кодируемый фотосенсибилизатор KillerRed.

Разработанные Чудаковым Д. М. флуоресцентные инструменты широко используются в научных лабораториях и на фармацевтических компаниях. Чудаков Д. М. является автором более 60 статей в рецензируемых журналах. Индивидуальный индекс цитирования: 3900. Индекс Хирша: 28.

Чудаков Д. М. принимал участие более чем в 40 международных конференциях, в большинстве случаев в качестве докладчика.

Чудаков Д. М. является соавтором ряда патентов и  международных патентных заявок.

Под руководством Чудакова Д.М. были защищены кандидатские диссертации:

Суслова Екатерина Андреевна, «Высококонтрастные генетически кодируемые сенсоры на основе зеленого флуоресцентного белка», 2008 год, по специальности  «Молекулярная биология».

Щербо Дмитрий Сергеевич, «Дальнекрасные флуоресцентные белки», 2010 год, по специальности  «Молекулярная биология».

Путинцева Екатерина Викторовна, "Разнообразие репертуаров Т-клеточных рецепторов человека и его изменения в ходе старения", 2014 год, по специальности  «Молекулярная биология».

 

Избранные публикации (показать все)

Загружаются...