Пресс-центр / новости / Наука /
7,8-дигидро-8-оксо-1,N6-этеноаденин: миметик тимина, спаривающийся исключительно Хугстиновской стороной в ДНК, который вызывает трансверсии A → T в Escherichia coli
Сотрудники Группы молекулярных инструментов для исследования живых систем и Лаборатории молекулярной диагностики ИБХ РАН с коллегами из Сколтеха, ФНКЦ физико-химической медицины, Массачусетского технологического института (США) и института химической физики «Рокасолано» (Испания) разработали ДНК модификацию, 7,8-дигидро-8-оксо-1,N6-этеноаденин (оксо-ϵA), не встречающееся в природе синтетическое основание, сочетающее в себе структурные особенности двух природных повреждений ДНК (7,8-дигидро-8-оксоаденин и 1,N6-этеноаденин).
González C, Zatsepin TS, Essigmann JM
УФ-, КД-, ЯМР-спектроскопия и молекулярное моделирование ДНК дуплексов показали, что оксо-ϵA принимает неканоническую син-конформацию (χ = 65º) и хорошо «укладывается» среди окружающих остатков нуклеиновых оснований, не вызывая заметных искажений в локальной архитектуре спирали. Модификация имитирует природное основание тимин. Если рассматривать оксо-ϵA как повреждение ДНК, возникающее из аденина, она является >99% мутагенной в живых клетках, вызывая преимущественно трансверсионные мутации A → T в Escherichia coli. Модификация в одноцепочечном векторе не репарируется ферментами эксцизионной репарации оснований (гликозилазами MutM и MutY) или диоксигеназой AlkB и не оказывает заметного влияния на эффективность репликации ДНК in vivo. Способность оксо-ϵA имитировать природное основание тимин и регулировать стабильность дуплексов, а также ее сильная флуоресценция и невидимость для ферментативных систем репарации in vivo являются свойствами, которые могут найти применение в разработке молекулярных инструментов и терапевтических средств на основе нуклеиновых кислот. Работа опубликована в журнале Nucleic Acids Research (IF 16.971).
3 марта 2022 года