Лаборатория биокатализа

Лаборатория биокатализа

Отдел пептидно-белковых технологий

Руководитель: Габибов Александр Габибович

биокатализ, каталитические антитела, аутоиммунные заболевания, протеасома, рекомбинантные белки, цитокины, интерфероны, гормон роста, протеолиз, пептидные ингибиторы

Лаборатория биокатализа была основана в ИБХ в 1997 г. В лаборатории развивается два основных проекта, которые идейно вышли из пионерских работ заведующего лабораторией профессора Габибова.

Первая группа под руководством Ивана Смирнова продолжает заниматься классической «абзимологией» (абзимы - антитела, обладающие свойствами ферментов), но уже на качественно новом уровне. Здесь ищется баланс между комбинаторными методами и рациональным дизайном с целью создания белков с заранее заданными свойствами de novo. В последнее время группа активно осваивает микрофлюидные технологии для осуществления многопараметрического скрининга клонов биокатализаторов и вообще клеток.

Вторая группа под руководством Алексея Белогурова изучает молекулярные основы аутоиммунных процессов с уклоном в аутоиммунную нейродегенерацию. В основном, на повестке дня стоит хроническое демиелинизирующее заболевание центральной нервной системы — рассеянный склероз, и в последнее время и нейродегенерация периферической нервной системы — синдром Гийена-Барре. В лаборатории разрабатываются скрининговые технологии, например дрожжевой, фаговый и лентивирусный дисплеи (в этих работах участвует группа Татьяны Бобик).

Ранее в лаборатории были достигнуты значительные успехи в области биотехнологии – экспрессии белков, например, факторов крови, антител в прокариотических системах и в клеточной линии СНО. Огромный вклад в эти исследования внесла профессор Наталья Пономаренко.

Лаборатория имеет широкий круг партнеров, как в Институте, так и за его пределами. Совместно с Лабораторией протеомики изучается рассеянный склероз и синдром Гийена-Барре, ведется работа над созданием иммунотоксинов с Лабораторией инженерии белка и Лабораторией молекулярной иммунологии, ведется изучение ионных каналов в аутореактивных лимфоцитах вместе с Группой молекулярных инструментов для нейробиологии.

Кроме того, Лаборатория сотрудничает с Европейской молекулярно-биологической лабораторией в Гамбурге, с НИИ физико-химической медицины, Центром нанотехнологий РАН, Институтом химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, НТЦ «БиоКлиникум» и НИИ физико-химической биологии им. А.Н. Белозерского МГУ. Лаборатория дружит и с несколькими выдающимися личностями: нобелевскими лауреатами Аароном Чехановером и Сиднеем Альтманом, бывшим президентом Института Скриппса и отцом современной абзимологии Ричардом Лернером и многими другими.

  • Общие проблемы биокатализа, структурно-функциональные взаимоотношения, определяющие каталитическую эффективность биокатализатора, искусственные ферменты, каталитические антитела-абзимы.
  • Проблемы индукции каталитической активности молекул суперсемейства иммуноглобулинов.
  • Антиидиотипические антитела как модель, обеспечивающая передачу функциональной активности белковой молекулы.
  • Проблемы природной каталитической активности и корреляция каталитической активности антител по отношению к аутоантигенам с глубиной развития патологических процессов.
  • Молекулярные основы аутоиммунных заболеваний. Роль протеасомы в аутоимунных патологиях ЦНС. Животные модели аутоиммунных процессов. Проблемы направленного элиминирования патологических В-лимфоцитов.
  • Создание каталитических вакцин, способных разрушать низкомолекулярные токсины, фосфорорганические яды и белки оболочки вирусов, в частности ВИЧ.
  • Каталитические антитела к биополимерам.
  • Антитела-протеазы и ДНКазы. Проблемы цитотоксичности аутоантител и механизмы апоптоза (совместно с Лабораторией иммунологии рака Института биологии гена РАН).
  • Протеазы, индуцируемые при аутоиммунных процессах. Протеазы патогенов (совместно с лабораторией химии ферментов ИБХ РАН). Комбинаторные подходы (в частности фаговый дисплей) для поиска эффективных субстратов протеаз. ДНК-топоизомеразы и механизмы взаимодействия с противораковыми препаратами. Механизмы действия эстераз.
  • Биотехнологические исследования (совместно с лабораторией биотехнологии ИБХ РАН): создание лекарственных препаратов на основе рекомбинантных белков, экспрессируемых в про- и эукариотических системах. Получение пролонгированных лекарственных средств с помощью полисиалирования, получение комбинированных ДНК-белковых вакцин.
  • Высказано предположение о наличии «природной каталитической активности» антител по отношению к аутоантигенам при патологических процессах в организме человека и у модельных животных.
  • Открыты природные ДНК-абзимы. Показаны цитотоксические эффекты этих антител. Установлен молекулярный механизм их действия на уровне 3D. Показано, что каталитические антитела могут быть получены как антиидиотипические антитела к ферментам.
  • Получена искусственная протеаза и ацетилхолинэстераза (совместно с технологическим университетом —  г. Компьень, Франция). Продемонстрировано ее специфическое взаимодействие с аналогами фосфорорганических отравляющих веществ.
  • Установлен механизм действия, получены кристаллы и разрешена трехмерная структура первого каталитического антитела, взаимодействующего с аналогами фосфорорганических отравляющих веществ. Показана ДНК-гидролизующая активность этого антитела и установлен механизм его действия.
  • Найден способ получения эпитоп-специфические каталитических антител-протеаз.
  • Получены антитела, специфически разрезающие поверхностный белок оболочки ВИЧ, gp120. Обнаружена сайт-специфическая деградация основного белка миелина под действием аутоантител, выделенных из сывороток крови больных рассеянным склерозом и модельных животных, развивающих ЕАЕ (экспериментальный аутоиммунный энцефаломиелит) и продемонстрирован диагностический и прогностический потенциал этого эффекта.
  • Установлена роль убиквитин-независимого протеолиза основного белка миелина в развитии нейродегенеративных патологий ЦНС.
  • Впервые предложен метод оптической детекции ДНК-топоизомеразной реакции. Установлен кинетический механизм ДНК-топоизомераз.
  • С помощью методов предстационарной кинетики установлен механизм действия летального фактора сибирской язвы.
  • Совместно с лабораторией биотехнологии ИБХ РАН получен отечественный препарат «Растан» (рекомбинантный гормон роста человека), колониестимулирующий фактор, рекомбинантный фактор свертывания крови VII.
ФИОДолжностьКонтакты
Габибов Александр Габибович, акад., проф., д.х.н.г.н.с.gabibov@ibch.ru
Бобик Т.В., к.х.н.с.н.с.
Ломакин Я.А., к.б.н.с.н.с.
Степанов Алексей Вячеславович, к.б.н.с.н.с.
Глаголева Ирина Сергеевна, к.б.н.н.с.
Захарова М.Ю., к.б.н.н.с.
Каминская А.Н.н.с.
Кнорре Вера Дмитриевна, к.х.н.н.с.
Костин Никита Николаевичн.с.
Курбацкая И.Н., к.б.н.н.с.
Скрябин Г.А.н.с.
Степанова Анастасия Валерьевнан.с.
Баранова Маргарита Николаевнам.н.с.
Волков Дмитрий Васильевичм.н.с.
Калинин Роман Сергеевичм.н.с.
Мамедов Азад Энверовичм.н.с.
Овчинникова Лейла Александровнам.н.с.
Украинская В.М.м.н.с.
Ишина И.А.инж.-иссл.
Назаров Антон Сергеевичинж.-иссл.
Голубева А.К.тех.-лаб.
Григорянц В.А.тех.-лаб.
Петрова Г.Ф.тех.-лаб.+7(495)995-55-57#2068
Рубинштейн И.Д.тех.-лаб.
Саватеева Наталья Сергеевнатех.-лаб.
Слуцкая Екатерина Александровнатех.-лаб.
Филимонова И.Н.тех.-лаб.
Хаврошечкина Е.В.тех.-лаб.
Быстров Николай Сергеевичинженер

Ранее здесь работали

Донцова Ольга Анатольевна, акад., проф., д.х.н.
Захарова М.Н.
Пономаренко Н.А., д.б.н.
Северин Е.С., Чл.-корр. РАН, д.х.н.
Тоневицкий Александр Григорьевич, Чл.-корр. РАН, проф., д.б.н.
Белогуров Алексей Анатольевич, д.х.н.
Колесников А.В., к.б.н.
Смирнов Иван Витальевич, д.х.н.
Воробьев И.И., д.х.н.
Воробьева Н.Е.
Горященко Александр Сергеевич, к.х.н.
Дронина М.А., к.б.н.
Дубилей С.А., к.б.н.
Дурова О.М.
Иванова М.В.
Илюшин Д.Г.
Козырь А.В., к.б.н.
Кудряева Анна Анатольевна, к.х.н.
Кузина Е.С.
Кулакова О.Г.
Орлова Н., к.б.н.
Симанив Т.О.
Терехов С.С., к.х.н.
Баулина Н.М.
Данилов Дмитрий Викторович
Киселев И.С.
Мокрушина Юлиана Анатольевна
Киприна А.А.
Попов Роман Юрьевич
Васькина Марина Ивановна
Пантелеев С.В.
Балагуров К.И.
Гайнова К.М.
Дуброво С.П.
Соколов А.В.
Терещук К.М.
Головин А.В.
Заболотский А.И.
Сокол М.Б.
Цабай Полина Николаевна
Загрузка...
Загрузка...

Габибов Александр Габибович

Москва, ул. Миклухо-Маклая, 16/10 — На карте

Помощник

Кнорре Вера Дмитриевна

Загрузка...