Новая Fe2+-зависимая люминесцентная система морских червей Chaetopterus variopedatus: структура, механизмы функционирования и возможности практического применения

Фундаментальной научной задачей, в рамках которой планируется представленный проект, является изучение механизмов биолюминесценции, т.е. физико-химических основ процесса преобразования энергии химических связей субстратов ферментативных реакций в кванты света. Целью настоящего проекта является всестороннее изучение работы биолюминесцентной системы морской полихеты Chaetopterus, основой свечения которой являются люциферин и люцифераза неизвестного строения. Наш коллектив долгое время занимается изучением фундаментальных основ явления биолюминесценции. Из известных на сегодняшний день девяти люциферинов структуры двух были установлены и подтверждены в нашей лаборатории. Так, за время работы нами были установлены структуры люциферинов и оксилюциферинов почвенных червей Fridericia heliota (Petushkov V.N. et al. Angew. Chem. Int. Ed., 2014, 53, 5566; Dubinnyi, M.A. et al. Angew. Chemie Int. Ed. 2015, 54, 7065) и высших грибов (Purtov K.V. et al. Angew. Chem. Int. Ed., 2015, 54, 8124; Kaskova, Z.M. et al. Sci. Adv. 2017, 3, e1602847), что привело к однозначному установлению двух новых уникальных механизмов биолюминесцентных реакций. В результате изучения этих биолюминесцентных систем был приобретен уникальный экспериментальный опыт и разработаны новые методики, позволяющие изучать явление биолюминесценции на мировом уровне. Визуализация образования и распространения органических перекисей в живых клетках является актуальной задачей для изучения причин возникновения и развития различных патологических процессов, таких как атеросклероз, хроническая сердечная недостаточность и преэклампсия. В ходе предварительного изучения биолюминесцентной системы морского червя Chaetopterus было установлено, что субстратом биолюминесценции Chaetopterus является органический пероксид (химическая природа субстрата – перекись липида). Полученные результаты говорят об актуальности более глубокого исследования люциферин-люциферазной системы Chaetopterus, аналогов которой на сегодняшний день не найдено среди известных биолюминесцентных систем. Биолюминесцентная система Chaetopterus является высоко перспективной для разработки в дальнейшем новых высокочувствительных методов мониторинга уровней липидного окисления в живых клетках. Для достижения поставленной цели необходимо решить ряд задач: выделить и очистить компоненты биолюминесцентной системы; изучить физико-химические свойства участников биолюминесцентной реакции; провести структурные исследования люциферина, его природных аналогов а также продуктов реакции биолюминесценции; клонировать ген новой люциферазы с получением бактериального и/или эукариотического штамма-суперпродуцента рекомбинантной люциферазы; на основе полученных данных установить механизм реакции и перспективы применения новой биолюминесцентной системы морских полихет Chaetopterus variopedatus в биомедицинских исследованиях. Пионерский характер проекта и его новизна обеспечивают полные возможности патентной защиты всех практически значимых результатов, связанных с использованием новой биолюминесцентной системы (новые люциферины, люциферазы и способы их применения) для разработки разнообразных новых систем биоимиджинга.

Список публикаций по проекту

  1. Mirza JD, Migotto AE, Yampolsky IV, Moraes GV, Tsarkova AS, Oliveira AG (2020). Chaetopterus variopedatus bioluminescence: A review of light emission within a species complex. Photochem Photobiol 96 (4), 768–778
  2. Tsarkova AS (2021). Luciferins Under Construction: A Review of Known Biosynthetic Pathways. Front Ecol Evol 9,
  3. Zagitova RI, Purtov KV, Shcheglov AS, Mineev KS, Dubinnyi MA, Myasnyanko IN, Belozerova OA, Pakhomova VG, Petushkov VN, Rodionova NS, Lushpa VA, Guglya EB, Kovalchuk S, Kozhemyako VB, Mirza JD, Oliveira AG, Yampolsky IV, Kaskova ZM, Tsarkova AS (2023). Conjugated Dienoic Acid Peroxides as Substrates in Chaetopterus Bioluminescence System. Int J Mol Sci 24 (11), 9466
  4. Kotlobay AA, Dubinnyi MA, Purtov KV, Guglya EB, Rodionova NS, Petushkov VN, Bolt YV, Kublitski VS, Kaskova ZM, Ziganshin RH, Nelyubina YV, Dorovatovskii PV, Eliseev IE, Branchini BR, Bourenkov G, Ivanov IA, Oba Y, Yampolsky IV, Tsarkova AS (2019). Bioluminescence chemistry of fireworm Odontosyllis. Proc Natl Acad Sci U S A 116 (38), 18911–18916