Свердлов Евгений Давидович

Личная информация

Работа по профессии

1962–1965: аспирант, Химический ф-т МГУ им. М. В. Ломоносова
1965–1988: научный сотрудник, руководитель группы, заведующий лабораторией Института биоорганической химии им. М. М. Шемякина АН СССР
1988–2006: директор Института молекулярной генетики РАН
2006–настоящее время: советник РАН, Научный руководитель Института молекулярной генетики РАН
1996–1998: внештатный профессор химии Бостонского Университета, США

Преподавательская деятельность

1984–1987: профессор химии, факультет физико-химической биологии Московского физико-технического института, Москва
1993–настоящее время: профессор молекулярной генетики, кафедра молекулярной биологии Биологического ф-та МГУ им. М. В. Ломоносова

Прочее

  • Руководитель более 70 кандидатских и 6 докторских диссертаций;
  • Главный редактор журнала “Молекулярная генетика, микробиология и вирусология”, Москва;
  • Член редколлегии журналов “Биоорганическая химия”, Москва; Доклады Российской академии наук, Москва; GENE, Нидерланды (до 2003 г.); International Journal of Genome Research, США;
  • Член Бюро Отделения биологических наук Российской академии наук;
  • Член Европейского общества генетики человека;
  • Член Всемирной организации генома человека (HUGO).

Книга “Органическая химия нуклеиновых кислот” переведена на английский язык под редакцией Нобелевского лауреата лорда А. Тодда и является настольной книгой химических лабораторий, занимающихся химией нуклеиновых кислот.

Образование

Период обученияСтрана, городУчебное заведениеДополнительная информация
1956–1961 Россия, Москва Московский государственный университет имени М.В. Ломоносова (МГУ), химический факультет Диплом химика
1962–1965 Россия, Москва Московский государственный университет имени М.В. Ломоносова (МГУ), химический факультет Диплом кандидата химических наук
1980 Россия, Москва Институт биоорганической химии им. М.М. Шемякина АН СССР (ИБХ) Диплом доктора химических наук

Премии и заслуги

1981 — Государственная премия СССР
1984 — Ленинская Премия СССР
1984 — Орден Трудового Красного Знамени
1999 — Орден Почета
2009 — Орден «За заслуги перед отечеством» 4 степени

Основные научные результаты

Основные труды посвящены разработке методов исследования генетического материала, анализу структур и функций генов, развитию теоретических основ современной биотехнологии и получению биотехнологических продуктов для медицины и сельского хозяйства. Результаты исследований опубликованы в более чем 300 печатных работах.

1967—1985. Серия исследований, посвященных развитию методов модификации нуклеиновых кислот и химических подходов к определению их последовательностей, вторичной структуры и функциональных свойств. Многие химические процессы, разработанные в этот период, в настоящее время рутинно используются в мировой лабораторной практике. В 1972—1973 был выдвинут и экспериментально обоснован основополагающий принцип определения последовательностей (Sverdlov et al. FEBS Letters, 28, 231, 1972; FEBS Letters 33, 15, 1973), который лежит в основе современных методов секвенирования нуклеиновых кислот.

1980—1991. Выполнена серия исследований по структуре и функциям бактериальных РНК-полимераз (совместно с лабораториями акад. Ю. А. Овчинникова и Р. Б. Хесина). Впервые в мире были определены первичные структуры РНК полимераз Е. coli, S. typhimurium и Pseudomonas putida. Впервые были идентифицированы мутации, вызывающие устойчивость микроорганизмов к антибиотику рифампицину и его производным и, таким образом, впервые получены данные о природе устойчивости к этому антибиотику M. tuberculosis, вызывающей серьезные проблемы при лечении туберкулеза. В ходе этих исследований были разработаны методы аффинной модификации комплексов белков с нуклеиновыми кислотами, которые также поныне используются в повседневной лабораторной практике. Эти работы получили широкое мировое признание, на них ссылаются в основных статьях и обзорах в данной области. Работы удостоены Государственной премии СССР.

1986—1991. Выполнена серия работ по изучению структуры и функций Na, K-АТФаз, являющихся важнейшим компонентом систем ионного транспорта в клетках животных и человека, нарушение которого приводит к сердечнососудистым заболеваниям. Впервые установлены структуры субъединиц и их генов у АТФаз свиньи и человека, показано существование семейств генов, кодирующих эти субъединицы, и определены особенности их экспрессии в разных тканях. Построены модели функциональной организации фермента в клетках.

В этот же период проведен ряд разработок в области биотехнологии, приведших, в частности к выделению генов интерферонов человека и созданию штаммов-продуцентов этих биорегуляторов, важных для медицины и сельского хозяйства. Генно-инженерный альфа-интерферон человека был первым отечественным генно-инженерным препаратом, используемым в клинике. Эти работы, проведенные совместно с ВНИИ генетики и селекции промышленных микроорганизмов, были удостоены Ленинской премии. Препарат рекомбинантного интерферона человека используется в клинике и поныне.

1992—2009. Разработаны методы широкомасштабного сравнительного анализа геномов человека и животных, а также их микробных патогенов, что имеет важное значение для понимания генетических основ патологий и принципов эволюционной и популяционной генетики. Наибольшее признание получила технология, известная в мире как супрессивная вычитающая гибридизация. Технология позволяет выявлять различия между продуктами экспрессии геномов в различных тканях, в том числе опухолевых и здоровых. В то же время проводятся исследования эндогенных ретровирусов, особенностей их структур и возможных патологических следствий их активности в геноме хозяйских клеток. Найдены способы одновременного анализа всех геномных ретровирусов, и в настоящее время проводится широкомасштабное исследование их экспрессии в разных тканях, опухолевых и здоровых клетках. Разработана серия методов, позволяющих идентификацию важнейших функциональных элементов геномов — регуляторов его транскрипции, энхансеров, инсуляторов, участков связывания транскрипционных факторов. Идентификация этих элементов необходима для понимания функционирования генома как интегральной системы в процессах жизнедеятельности, возникновения новых функций в процессе эволюции и их нарушений при различных патологиях.

Членство в научных обществах

Членство в Академиях

1984 — член-корреспондент АН СССР
1991 — академик РАСХН
1997 — действительный член Российской академии наук
2001 — Немецкая академия Leopoldina
2001 — Европейская академия наук

Избранные публикации

  1. Kopantzev E.P., Monastyrskaya G.S., Vinogradova T.V., Zinovyeva M.V., Kostina M.B., Filyukova O.B., Tonevitsky A.G., Sukhikh G.T., Sverdlov E.D. (2008). Differences in gene expression levels between early and later stages of human lung development are opposite to those between normal lung tissue and non-small lung cell carcinoma. Lung Cancer 62 (1), 23–34 [+]

    We, for the first time, directly compared gene expression profiles in human non-small cell lung carcinomas (NSCLCs) and in human fetal lung development. Previously reported correlations of gene expression profiles between lung cancer and lung development, deduced from matching data on mouse development and human cancer, have brought important information, but suffered from different timing of mouse and human gene expression during fetal development and fundamental differences in tumorigenesis in mice and humans. We used the suppression subtractive hybridization technique to subtract cDNAs prepared from human fetal lung samples at weeks 10-12 and 22-24 and obtained a cDNA library enriched in the transcripts more abundant at the later stage. cDNAs sequencing and RT-PCR analysis of RNAs from human fetal and adult lungs revealed 12 differentially transcribed genes: ADH1B, AQP1, FOLR1, SLC34A2, CAV1, INMT, TXNIP, TPM4, ICAM-1, HLA-DRA, EFNA1 and HLA-E. Most of these genes were found up-regulated in mice and rats at later stages than in human lung development. In surgical samples of NSCLC, these genes were down-regulated as compared to surrounding normal tissues and normal lungs, thus demonstrating opposite expression profiles for the genes up-regulated during fetal lung development.

    ID:4
  2. Chernov I.P., Timchenko K.A., Akopov S.B., Nikolaev L.G., Sverdlov E.D. (2007). Identification of tissue-specific DNA-protein binding sites by means of two-dimensional electrophoretic mobility shift assay display. Anal. Biochem. 364 (1), 60–6 [+]

    We developed a technique of differential electrophoretic mobility shift assay (EMSA) display allowing identification of tissue-specific protein-binding sites within long genomic sequences. Using this approach, we identified 10 cell type-specific protein-binding sites (protein target sites [PTSs]) within a 137-kb human chromosome 19 region. In general, tissue-specific binding of proteins from different nuclear extracts by individual PTSs did not follow the all-or-nothing principle. Most often, PTS-protein complexes were formed in all cases, but they were different for different nuclear extracts used.

    ID:5
  3. Bulanenkova S., Snezhkov E., Nikolaev L., Sverdlov E. (2007). Identification and mapping of open chromatin regions within a 140 kb polygenic locus of human chromosome 19 using E. coli Dam methylase. Genetica 130 (1), 83–92 [+]

    Using transient expression of the E. coli Dam methylase gene and analysis of the distribution of methylated GATC sites, we studied the distribution of open chromatin regions within a 140 kb long human genome segment in HEK-293 cells. Dam methylated sites were found in gene introns, exons, and intergenic regions, and their distribution along DNA was uneven. There were regions of high and low density of Dam methylated GATC sites, presumably corresponding to "open" and "closed" chromatin regions, respectively, and to the functional profile of the genomic locus under study. The Dam methylation profile was also generally in agreement with transcriptional activity of genes in the locus. Moreover, DNA regions accessible to Dam methylase apparently coincided with those hypersensitive to DNase I.

    ID:11
  4. Lebedev Y.B., Amosova A.L., Mamedov I.Z., Fisunov G.Y., Sverdlov E.D. (2007). Most recent AluY insertions in human gene introns reduce the content of the primary transcripts in a cell type specific manner. Gene 390 (1-2), 122–9 [+]

    Предложена общая стратегия широко масштабного анализа влияния ретроэлементов на функционирование генома приматов, использующая явление инсерционного полиморфизма Alu элементов генома человека. Предложен метод сравнения транскрипционной активности аллельных вариантов генов человека, отличающихся по интронным инсерциям AluY элементов. Открыт ингибиторный эффект диморфных AluY инсерций на экспрессию пораженного аллеля и показан тканеспецифический характер проявления обнаруженного эффекта.

    ID:100
  5. Illarionova A.E., Vinogradova T.V., Sverdlov E.D. (2007). Only those genes of the KIAA1245 gene subfamily that contain HERV(K) LTRs in their introns are transcriptionally active. Virology 358 (1), 39–47 [+]

    Insertion of LTRs into some genome locations might seriously affect regulation of the neighboring genes expression. This hypothesis is widely accepted but, however, not confirmed directly. Earlier, we have identified a family of closely related genes highly similar to the KIAA1245 mRNA counterpart. This family included a subfamily of genes some of which contained and the others lacked an LTR in their structure. We compared transcription of several closely related genes of the subfamily differing in the presence or absence of LTRs. Only LTR-containing genes were transcribed in transformed cell lines, tumorous and embryonic human tissues, whereas LTR-lacking genes remained silent. Since the genes were in the same intracellular microenvironment, we suggested that this effect was most probably due to intrinsic cis-characteristics of integrated LTRs and confirmed this by demonstrating high enhancer activity of KIAA1245 LTRs. The expression of the LTR-containing genes in embryonic tissues might suggest their involvement in evolutionary events during primate speciation.

    ID:6
  6. Buzdin A., Kovalskaya-Alexandrova E., Gogvadze E., Sverdlov E. (2006). At least 50% of human-specific HERV-K (HML-2) long terminal repeats serve in vivo as active promoters for host nonrepetitive DNA transcription. J. Virol. 80 (21), 10752–62 [+]

    В статье приведены результаты полногеномного исследования, выявившего, что более 50% всех специфичных для ДНК человека вставок эндогенных ретровирусов активны как промоторы для соседних уникальных участков генома

    ID:16
  7. Akopov S.B., Ruda V.M., Batrak V.V., Vetchinova A.S., Chernov I.P., Nikolaev L.G., Bode J., Sverdlov E.D. (2006). Identification, genome mapping, and CTCF binding of potential insulators within the FXYD5-COX7A1 locus of human chromosome 19q13.12. Mamm. Genome 17 (10), 1042–9 [+]

    Identification of insulators is one of the most difficult problems in functional mapping of genomes. For this reason, up to now only a few insulators have been described. In this article we suggest an approach that allows direct isolation of insulators by a simple positive-negative selection based on blocking enhancer effects by insulators. The approach allows selection of fragments capable of blocking enhancers from mixtures of genomic fragments prepared from up to 1-Mb genomic regions. Using this approach, a 1-Mb human genome locus was analyzed and eight potential insulators were selected. Five of the eight sequences were positioned in intergenic regions and two were within introns. The genes of the alpha-polypeptide H+/K+ exchanging ATPase (ATP4A) and amyloid beta (A4) precursor-like protein 1 (APLP1) within the locus studied were found to be flanked by insulators on both sides. Both genes are characterized by distinct tissue-specific expression that differs from the tissue specificity of the surrounding genes. The data obtained are consistent with the conception that insulators subdivide genomic DNA into loop domains that comprise genes characterized by similar expression profiles. Using chromatin immunoprecipitation assay, we demonstrated also that at least six of the putative insulators revealed in this work could bind the CTCF transcription factor in vivo. We believe that the proposed approach could be a useful instrument for functional analysis of genomes.

    ID:13
  8. Fushan A., Monastyrskaya G., Abaev I., Sverdlov E. (2006). Genomic fingerprinting of Burkholderia pseudomallei and B. mallei pathogens with DNA array based on interspecies sequence differences obtained by subtractive hybridization. Res. Microbiol. 157 (7), 684–92 [+]

    The ability to rapidly and efficiently identify causative agents of dangerous human and animal diseases is a prerequisite to diagnosis, prophylaxis and therapy. Such identification systems can be developed based on DNA markers enabling differentiation between various bacterial strains. One source of these markers is genetic polymorphism. An efficient method for detecting the most stable polymorphisms without knowledge of genomic sequences is subtractive hybridization. In this work we report an approach to typing of Burkholderia pseudomallei and B. mallei that cause melioidosis and glanders, respectively. Typing is based on hybridization of bacterial genomes with a DNA array of genomic markers obtained using subtractive hybridization. The array comprised 55 DNA fragments which distinguished the genomes of B. pseudomallei C-141 and B. mallei C-5 strains, and it was used to test 28 radioactively labeled B. pseudomallei strains and 8 B. mallei strains. Each strain was characterized by a specific hybridization pattern, and the results were analyzed using cluster analysis. 18 patterns specific to B. pseudomallei and 6 patterns specific to B. mallei were found to be unique. The data allowed us to differentiate most studied B. pseudomallei variants from one another and from B. mallei strains. It was concluded that DNA markers obtained by subtractive hybridization can be potentially useful for molecular typing of B. pseudomallei and B. mallei strains, as well as for their molecular diagnosis. The method reported can be easily adapted for use both with DNA arrays and DNA microarrays with fluorescent probes.

    ID:12
  9. Vetchinova A.S., Akopov S.B., Chernov I.P., Nikolaev L.G., Sverdlov E.D. (2006). Two-dimensional electrophoretic mobility shift assay: identification and mapping of transcription factor CTCF target sequences within an FXYD5-COX7A1 region of human chromosome 19. Anal. Biochem. 354 (1), 85–93 [+]

    An approach for fast identification and mapping of transcription factor binding sites within long genomic sequences is proposed. Using this approach, 10 CCCTC-binding factor (CTCF) binding sites were identified within a 1-Mb FXYD5-COX7A1 human chromosome 19 region. In vivo binding of CTCF to these sites was verified by chromatin immunoprecipitation assay. CTCF binding sites were mapped within gene introns and intergenic regions, and some of them contained Alu-like repeated elements.

    ID:9
  10. Chernov I.P., Akopov S.B., Nikolaev L.G., Sverdlov E.D. (2006). Identification and mapping of DNA binding proteins target sequences in long genomic regions by two-dimensional EMSA. BioTechniques 41 (1), 91–6 [+]

    Specific binding of nuclear proteins, in particular transcription factors, to target DNA sequences is a major mechanism of genome functioning and gene expression regulation in eukaryotes. Therefore, identification and mapping specific protein target sites (PTS) is necessary for understanding genomic regulation. Here we used a novel two-dimensional electrophoretic mobility shift assay (2D-EMSA) procedure for identification and mapping of 52 PTS within a 563-kb human genome region located between the FXYD5 and TZFP genes. The PTS occurred with approximately equal frequency within unique and repetitive genomic regions. PTS belonging to unique sequences tended to group together within gene introns and close to their 5' and 3' ends, whereas PTS located within repeats were evenly distributed between transcribed and intragenic regions.

    ID:14
  11. Azhikina T., Gainetdinov I., Skvortsova Y., Sverdlov E. (2006). Methylation-free site patterns along a 1-Mb locus on Chr19 in cancerous and normal cells are similar. A new fast approach for analyzing unmethylated CCGG sites distribution. Mol. Genet. Genomics 275 (6), 615–22 [+]

    We describe a newly developed technique for rapid identification of positions of genomic DNA breaks, preexisting or introduced by specific digestion, in particular, by restriction endonucleases (RIDGES). We applied RIDGES in analyzing unmethylated CCGG sites distribution along a 1-Mb long genome region (D19S208-COX7A1 on chromosome 19) in cancerous and normal lung tissues. Both tissues were characterized by a profoundly uneven density of unmethylated sites along the fragment. Interestingly, the distribution of hypomethylated regions did not correlate with gene locations within the fragment, and one of the most hypomethylated areas contained practically no genes. We also demonstrated that the methylation pattern of a long genome DNA fragment was rather stable and practically unchanged in human lung cancer tissue as compared with its normal counterpart, in accordance with the suggestion (Ross et al. in Nat Genet 24:227-235, 2000) that cell lines of common origin have typically similar transcription profiles. An analogous suggestion might probably be made for global methylation patterns of genomic DNA.

    ID:10
  12. Azhikina T., Gvozdevsky N., Botvinnik A., Fushan A., Shemyakin I., Stepanshina V., Lipin M., Barry C. 3rd, Sverdlov E. (2006). A genome-wide sequence-independent comparative analysis of insertion-deletion polymorphisms in multiple Mycobacterium tuberculosis strains. Res. Microbiol. 157 (3), 282–90 [+]

    We applied an enhanced version of subtractive hybridization for comparative analyses of indel differences between genomes of several Mycobacterium tuberculosis strains widespread in Russian regions, and the H37Rv reference strain. A number of differences were detected and partially analyzed, thus demonstrating the practicality of the approach. A majority of the insertions found were shared by all Russian strains, except for strain 1540 that revealed the highest virulence in animal tests. This strain possesses a number of genes absent from other clinical strains. Two of the differential genes were found to encode putative membrane proteins and are presumed to affect mycobacterial interaction with the host cell, thus enhancing virulent properties of the isolate. The method used is of general application, and enables the elaboration of a catalogue of indel polymorphic genomic differences between closely related strains.

    ID:8
  13. Kovalskaya E., Buzdin A., Gogvadze E., Vinogradova T., Sverdlov E. (2006). Functional human endogenous retroviral LTR transcription start sites are located between the R and U5 regions. Virology 346 (2), 373–8 [+]

    Human endogenous retroviruses (HERVs) occupy about 5% of human DNA and are thought to be remnants of ancient retroviral infections of human ancestors' germ cells. HERVs can modify expression of host cell genes through their cis-regulatory elements concentrated in their long terminal repeats (LTRs). Although numerous HERV-related RNAs were identified in the human transcriptome, for most of them, it remains unclear whether they are LTR-promoted or read-through products initiated from neighboring genomic promoters. Here, we describe mapping of transcriptional start sites within solitary and proviral LTRs of the HERV-K (HML-2) human-specific subfamily of endogenous retroviruses. Surprisingly, the transcription was initiated predominantly from the very 3' termini of the LTR R regions. The data presented here may shed light on adaptive coevolution of human endogenous retroviruses with their host cells.

    ID:7
  14. Buzdin A., Kovalskaya-Alexandrova E., Gogvadze E., Sverdlov E. (2006). GREM, a technique for genome-wide isolation and quantitative analysis of promoter active repeats. Nucleic Acids Res. 34 (9), e67 [+]

    В статье опубликован новый метод, позволяющий проводить мониторинг транскрипционной активности повторяющихся элементов генома на полногеномном уровне

    ID:15
  15. Mamedov I.Z., Arzumanyan E.S., Amosova A.L., Lebedev Y.B., Sverdlov E.D. (2005). Whole-genome experimental identification of insertion/deletion polymorphisms of interspersed repeats by a new general approach. Nucleic Acids Res. 33 (2), e16 [+]

    Разработана уникальная технология экспериментального сравнительно-структурного анализа смесевых образцов геномной ДНК, направленная на полногеномную идентификацию полиморфных инсерций отдельных классов ретроэлементов. Эффективность нового экспериментального подхода к изучению инсерционного полиморфизма ретроэлементов генома человека доказана открытием обширной группы диморфных инсерций AluY элементов, до 40% представителей которой не могли быть идентифицированы биоинформатическими методами анализа.

    ID:99
  16. Buzdin A., Gogvadze E., Kovalskaya E., Volchkov P., Ustyugova S., Illarionova A., Fushan A., Vinogradova T., Sverdlov E. (2003). The human genome contains many types of chimeric retrogenes generated through in vivo RNA recombination. Nucleic Acids Res. 31 (15), 4385–90 [+]

    В статье сообщается об открытии группы ретроэлементов, сформированных по принципиально новому механизму: при помощи смены матриц в ходе обратной транскрипции РНК ретроэлементов LINE млекопитающих.

    ID:20
  17. Buzdin A., Ustyugova S., Gogvadze E., Lebedev Y., Hunsmann G., Sverdlov E. (2003). Genome-wide targeted search for human specific and polymorphic L1 integrations. Hum. Genet. 112 (5-6), 527–33 [+]

    Эффективное применение оригинального метода вычитающей гибридизации геномной ДНК для идентификации видоспецифических инсерций LINE ретропозонов.

    ID:97
  18. Buzdin A., Ustyugova S., Khodosevich K., Mamedov I., Lebedev Y., Hunsmann G., Sverdlov E. (2003). Human-specific subfamilies of HERV-K (HML-2) long terminal repeats: three master genes were active simultaneously during branching of hominoid lineages. Genomics 81 (2), 149–56 [+]

    Полный структурный анализ специфичных для генома человека LTR-элементов. Впервые доказана множественная ретропозиция эндогенных ретровирусов в ходе эволюции генома человека.

    ID:96
  19. Mamedov I., Batrak A., Buzdin A., Arzumanyan E., Lebedev Y., Sverdlov E.D. (2002). Genome-wide comparison of differences in the integration sites of interspersed repeats between closely related genomes. Nucleic Acids Res. 30 (14), e71 [+]

    Представлен окончательный вариант экспериментального подхода к полногеномному сравнительному анализу распределения участков интеграции LTR-элементов в геномах близкородственных видов. Впервые идентифицировано и предварительно охарактеризовано 11 инсерций LTR-элементов, отличающих геном человека от генома шимпанзе.

    ID:18
  20. Buzdin A., Khodosevich K., Mamedov I., Vinogradova T., Lebedev Y., Hunsmann G., Sverdlov E. (2002). A technique for genome-wide identification of differences in the interspersed repeats integrations between closely related genomes and its application to detection of human-specific integrations of HERV-K LTRs. Genomics 79 (3), 413–22 [+]

    В статье опубликован новый метод, позволяющий сравнивать распределение геномных повторов между близкородственными геномами при помощи метода вычитающей гибридизации

    ID:17
  21. Sverdlov E.D. (2000). Retroviruses and primate evolution. BioEssays 22 (2), 161–171 [+]

    Human endogenous retroviruses (HERVs), probably representing footprints of ancient germ-cell retroviral infections, occupy about 1% of the human genome. HERVs can influence genome regulation through expression of retroviral genes, either via genomic rearrangements following HERV integrations or through the involvement of HERV LTRs in the regulation of gene expression. Some HERVs emerged in the genome over 30 MYr ago, while others have appeared rather recently, at about the time of hominid and ape lineages divergence. HERVs might have conferred antiviral resistance on early human ancestors, thus helping them to survive. Furthermore, newly integrated HERVs could have changed the pattern of gene expression and therefore played a significant role in the evolution and divergence of Hominoidea superfamily. Comparative analysis of HERVs, HERV LTRs, neighboring genes, and their regulatory interplay in the human and ape genomes will help us to understand the possible impact of HERVs on evolution and genome regulation in the primates.

    ID:19
  22. Lebedev Y.B., Belonovitch O.S., Zybrova N.V., Khil P.P., Kurdyukov S.G., Vinogradova T.V., Hunsmann G., Sverdlov E.D. (2000). Differences in HERV-K LTR insertions in orthologous loci of humans and great apes. Gene 247 (1-2), 265–77 [+]

    Впервые предложена техника селективной ПЦР-амплификации участков интеграции ретроэлементов. По результатам сравнительно-сруктурного и эволюционного анализа LTR-элементов разработана детальная систематика эндогенных ретровирусов семейства К (HERV-K) и показано существование волн ретропозиций HERV-K в эволюции генома, совпадающих по времени со временем дивергенции основных линий приматов. Доказано существование специфичной для генома человека группы LTR-элементов

    ID:98
  23. Ovchinnikov Yu.A., Monastyrskaya G.S., Gubanov V.V., Guryev S.O., Salomatina I.S., Shuvaeva T.M., Lipkin V.M., Sverdlov E.D. (1982). The primary structure of E. coli RNA polymerase, Nucleotide sequence of the rpoC gene and amino acid sequence of the beta'-subunit. Nucleic Acids Res. 10 (13), 4035–44 [+]

    The primary structure of the E. coli rpoC gene (5321 base pairs) coding the beta'-subunit of RNA polymerase as well as its adjacent segment have been determined. The structure analysis of the peptides obtained by cleavage of the protein with cyanogen bromide and trypsin has confirmed the amino acid sequence of the beta'-subunit deduced from the nucleotide sequence analysis. The beta'-subunit of E. coli RNA polymerase contains 1407 amino acid residues. Its translation is initiated by codon GUG and terminated by codon TAA. It has been detected that the sequence following the terminating codon is strikingly homologous to known sequences of rho-independent terminators.

    ID:54