Пресс-центр / Дайджест
Включение в наноматериалы усиливает антикоагулянтную активность аденозина и дипептида IleTrp
Сотрудники Лаборатории молекулярной токсинологии совместно с учеными Института наук о прикладных материалах Вьетнамской академии наук и технологий показали, что включение дипептида IleTrp (IW) и аденозина (Ado) в наноматериалы существенно повышает их антикоагулятную активность. Ado и IW были включены в термочувствительный наногель, состоящий из гепарина, к которому ковалентно присоединен полимер плюроник P123. При измерении биологической активности in vivo было обнаружено, что инкапсуляция этих соединений в наноматериал значительно усилила их действие, что выражается в увеличении времени кровотечения. Исследование опубликовано в журнале Nanomaterials. Работа выполнена при поддержке Российского фонда фундаментальных исследований. Подробнее
VDJdb - база данных Т-клеточных рецепторов: update 2019
База данных VDJdb, содержащая последовательности Т-клеточных рецепторов (TCR) с охарактеризованной специфичностью, была создана группой сотрудников отдела Геномики адаптивного иммунитета ИБХ в сотрудничестве с зарубежными коллегами в 2017 году. В недавно опубликованной статье в Nucleic Acid Research авторы представили обновленную версию, включающую два дополнительных режима анализа данных. Обновленная версия содержит более 60 000 последовательностей TCR человека, мыши и других позвоночных, для которых показана специфичность к более чем 200 эпитопам из белков различных патогенов и селф-антигенов. Обновление также включает несколько дополнительных способов анализа. Внесенные дополнения и расширение объема VDJdb существенно повышает эффективность использования этого инструмента при исследовании системы адаптивного иммунитета. Подробнее
Пептиды, кодируемые короткими открытыми рамками считывания, регулируют рост и развитие у растений
Группа сотрудников Лаборатории функциональной геномики и протеомики растений ИБХ совместно с учёными из ФНКЦ ФХМ и ИБМХ опубликовала исследование коротких открытых рамок у модельного организма – мха Physcomitrella patens – в авторитетном международном журнале Genome Research. Авторы идентифицировали около 70 000 транскрибирующихся коротких открытых рамок считывания, расположенных на длинных некодирующих РНК и различных частях матричных РНК. Протеомными и пептидомными методами была обнаружена трансляция пептидов от нескольких десятков коротких рамок. Анализ мутантных линий мха с нокаутом и сверхэкспрессией некоторых из них, расположенных на длинных некодирующих РНК позволил выявить, что кодируемые пептиды играют важную роль в регуляции роста и развития мха. Исследование выполнено при поддержке Российского Научного Фонда. Подробнее
Тайна свечения огненных червей раскрыта: молекулярные основы биолюминесценции Odontosyllis
Биолюминесценция, «холодный свет», излучаемый живыми организмами, - это широко распространенное природное явление. В его основе лежит катализируемая ферментом реакция окисления низкомолекулярного субстрата, энергия которой высвобождается в виде света. Для более чем 40 известных на данный момент биолюминесцентных систем известны структуры всего 9 субстратов – люциферинов, причем полный путь биосинтеза, для которого были бы известны все ферменты участники, описан лишь для двух из них. Совместные усилия международной команды ученых привели к открытию нового люциферина из морской полихеты Odontosyllis undecimdonta. Описание структур трех ключевых низкомолекулярных компонентов биолюминесцентной системы Odontosyllis, представленное в статье, опубликованной в журнале Proceedings of the National Academy of Sciences USA, позволило так же прояснить молекулярные основы биолюминесценции данного организма. Подробнее
Трансмембранный пептид против вируса Эпштейна-Барр
Вирус Эпштейна-Барр чрезвычайно широко распространен в человеческой популяции, им заражены до 90% населения планеты. Во многих случаях скрытая инфекция приводит к серьезным нарушениям, например к лимфомам. Важную роль в этом процессе играет белок вируса LMP1. Он имитирует действие одного из рецепторов лимфоцитов, заставляя их бесконтрольно делиться. Группа китайских ученых из Института прикладной химии г. Чанчунь при участии сотрудника Лаборатории биомолекулярной ЯМР-спектроскопии ИБХ РАН Константина Минеева разработали молекулу, ингибирующую LMP1. Что нетипично, полученное вещество - это трансмембранный пептид, а механизм его действия - нарушать белок-белковые взаимодействия LMP1 в мембране. Эффективность молекулы как лекарства пока недостаточно высока, однако разработанные подходы позволяют надеяться на получение более перспективного соединения в будущем. Работа опубликована в журнале Chemical Science.