Институт
биоорганической химии

Ученые из Университета Копенгагена, Университета Южной Дании, Мемориального ракового центра им. Слоан Кеттеринг в Нью-Йорке и Беларусского Государственного Университета совместно с сотрудником Лаборатории Биоинформатических Методов Комбинаторной Химии и Биологии ИБХ РАН Ковальчуком С.И. исследовали роль белка PRMT5 в клетке и его онкогенную активность на примере клеток Острой Миелоидной Лейкемии. Было показано, что PRMT5 посредством метилирования регулирует активность белка SRSF1, который в свою очередь отвечает за альтернативный сплайсинг. Подавление PRMT5 приводит к изменениям в альтернативном сплайсинге ряда критически-важных генов и к гибели раковых клеток. На основе полученных данных могут быть разработаны тесты для контроля терапевтического ответа на ингибиторы PRMT5 при лечении раковых заболеваний. Работа опубликована в журнале Nature Structural and Molecular Biology. Подробнее

Группа ученых из Лаборатории молекулярных основ эмбриогенеза ИБХ РАН совместно с коллегами из лаборатории математических методов и моделей в биоинформатике ИППИ РАН разработала биоинформатический метод, позволяющий прицельно находить гены, появившиеся или наоборот исчезнувшие на определенном этапе эволюции. С помощью этого метода был найден ряд генов, исчезнувших у теплокровных животных, в том числе у человека. Для дальнейшего изучения был выбран только один из таких генов, кодирующий неизвестный ранее белок, и на его примере была подтверждена справедливость гипотезы о роли исчезнувших генов в прогрессивном развитии головного мозга и в потере регенерационной способности у теплокровных. При этом, этот трансмембранный белок (c-Answer) является новым модулятором FGF и ADP сигнализации. Результаты опубликованы в журнале Cell Reports. Подробнее

Сотрудники Лаборатории молекулярной токсинологии совместно с учеными Института наук о прикладных материалах Вьетнамской академии наук и технологий показали, что включение дипептида IleTrp (IW) и аденозина (Ado) в наноматериалы существенно повышает их антикоагулятную активность. Ado и IW были включены в термочувствительный наногель, состоящий из гепарина, к которому ковалентно присоединен полимер плюроник P123. При измерении биологической активности in vivo было обнаружено, что инкапсуляция этих соединений в наноматериал значительно усилила их действие, что выражается в увеличении времени кровотечения. Исследование опубликовано в журнале Nanomaterials. Работа выполнена при поддержке Российского фонда фундаментальных исследований. Подробнее

База данных VDJdb, содержащая последовательности Т-клеточных рецепторов (TCR) с охарактеризованной специфичностью, была создана группой сотрудников отдела Геномики адаптивного иммунитета ИБХ в сотрудничестве с зарубежными коллегами в 2017 году. В недавно опубликованной статье в Nucleic Acid Research авторы представили обновленную версию, включающую два дополнительных режима анализа данных. Обновленная версия содержит более 60 000 последовательностей TCR человека, мыши и других позвоночных, для которых показана специфичность к более чем 200 эпитопам из белков различных патогенов и селф-антигенов. Обновление также включает несколько дополнительных способов анализа. Внесенные дополнения и расширение объема VDJdb существенно повышает эффективность использования этого инструмента при исследовании системы адаптивного иммунитета. Подробнее

Группа сотрудников Лаборатории функциональной геномики и протеомики растений ИБХ совместно с учёными из ФНКЦ ФХМ и ИБМХ опубликовала исследование коротких открытых рамок у модельного организма – мха Physcomitrella patens – в авторитетном международном журнале Genome Research. Авторы идентифицировали около 70 000 транскрибирующихся коротких открытых рамок считывания, расположенных на длинных некодирующих РНК и различных частях матричных РНК. Протеомными и пептидомными методами была обнаружена трансляция пептидов от нескольких десятков коротких рамок. Анализ мутантных линий мха с нокаутом и сверхэкспрессией некоторых из них, расположенных на длинных некодирующих РНК позволил выявить, что кодируемые пептиды играют важную роль в регуляции роста и развития мха. Исследование выполнено при поддержке Российского Научного Фонда. Подробнее